关于商品房底层商铺一半面积在主楼基础下产权的计算划分及开发商出售合法性的问题，分析如下：
一、产权计算与划分
产权归属原则：
- 产权的归属通常依据规划、设计以及购房合同中的约定来确定。若商铺的一半面积位于主楼基础下，这部分面积是否计入商铺产权，需详细审查购房合同、规划图纸以及相关法律法规。
- 根据《中华人民共和国民法典》及相关房产法规，建筑物的产权划分应遵循规划、设计文件，并确保不损害其他业主的合法权益。若主楼基础下的部分被规划为商铺的一部分，且未侵犯其他业主权益，则该部分应计入商铺产权。
产权划分方式：
- 产权的划分可能涉及面积测量、比例分配等具体操作。若商铺与主楼基础下的部分有明确的界限，且该界限在规划、设计文件中得到确认，则产权划分相对明确。
- 若界限模糊或存在争议，可能需要通过专业机构进行面积测量，并依据测量结果和相关法律法规进行产权划分。
二、开发商出售的合法性
合法出售的前提：
- 开发商出售商铺的前提是拥有合法的产权证明，且出售行为符合相关法律法规和规划、设计要求。
- 若商铺的一半面积位于主楼基础下，开发商需确保该部分面积已纳入商铺产权，且未侵犯其他业主的合法权益。同时，出售行为需经过相关部门的审批和备案。
可能存在的法律风险：
- 若开发商未取得合法的产权证明或出售行为违反相关法律法规和规划、设计要求，则可能面临法律纠纷和行政处罚。
- 购房者若购买此类商铺，可能面临产权纠纷、无法办理产权证等风险。因此，在购买前应仔细审查开发商的产权证明和出售行为的合法性。
三、建议与措施
审查购房合同与规划图纸：
- 购房者在购买前应仔细审查购房合同和规划图纸，确保商铺的产权划分明确且合法。
- 若对产权划分存在疑问，可要求开发商提供详细的产权证明和规划、设计文件。
咨询专业机构：
- 若产权划分存在争议或购房者对开发商的出售行为合法性存在疑问，可咨询专业机构或律师进行法律评估和风险分析。
关注法律法规变化：
- 购房者和开发商应关注相关法律法规的变化，确保出售和购买行为符合最新要求。
总结来说，商品房底层商铺一半面积在主楼基础下的产权计算与划分需依据规划、设计文件和购房合同来确定。开发商出售此类商铺的合法性取决于其是否拥有合法的产权证明且出售行为符合相关法律法规和规划、设计要求。购房者在购买前应仔细审查相关文件并咨询专业机构以降低法律风险。若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。