商铺改成住房是否算自有住房以及是否合法，这主要取决于是否满足相关规划、建筑安全、土地用途等要求，并经过法定程序审批。未经批准擅自改变用途通常是不合法的，而满足一定条件并经过审批后，商铺改住房可以合法化，但此时它是否算自有住房还需看产权归属。以下从不同角度为您详细分析：
一、不合法情况分析
违反规划用途：
- 城市规划对土地和建筑物的用途有严格划分，商铺属于商业用途，住宅则属于居住用途。若未经法定程序变更规划用途，将商铺擅自改为住宅，即违反了城市规划管理规定，这种改造行为是不合法的。
不符合建筑安全规范：
- 商铺与住宅在建筑设计上有不同的规范要求。商铺的设计通常基于商业使用需求，在消防、通风、给排水等方面可能与住宅标准不符。因此，将商铺改为住宅可能无法满足居住的安全、卫生等要求，存在潜在的安全隐患，这种改造也是不被允许的。
违反土地出让合同约定：
- 开发商在取得土地开发权时，与政府签订的土地出让合同中明确规定了土地用途。若将商铺改为住宅，即违反了合同约定，政府相关部门有权追究责任，并可能面临法律制裁。
二、合法化途径与条件
申请规划变更：
- 若希望将商铺改为住宅，首先需向当地规划部门提出申请，说明变更用途的理由和方案。经过规划部门的审核并获得批准后，方可进行改造。这是确保改造行为合法性的关键步骤。
满足相关技术规范：
- 改造后的住宅必须严格遵守住宅建筑的各项技术规范和标准，包括但不限于消防安全、建筑结构安全、采光通风等要求。这是确保居住安全和舒适性的重要前提。
获得相关利害关系人同意：
- 改造行为可能影响同一栋楼或其他相邻业主的权益，如增加公共设施使用压力等。因此，在改造前需获得这些利害关系人的同意，以避免潜在的纠纷和法律风险。
办理相关手续：
- 根据相关法律法规，改变土地使用权出让合同约定的土地用途时，必须取得出让方和市、县人民政府城市规划行政主管部门的同意，并签订土地使用权出让合同变更协议或重新签订土地使用权出让合同。同时，涉及不动产物权的变更还需依法登记才发生效力。
三、关于是否算自有住房
- 产权归属是关键：即使商铺改住房经过合法审批，它是否算自有住房还需看产权归属。如果产权仍然属于原商铺所有者或开发商，那么即使您居住在其中，也不能算作自有住房。只有当您通过购买、继承等方式获得了该房产的产权，它才能算作您的自有住房。
四、法律依据
- 《中华人民共和国城市房地产管理法》第十八条：明确规定了改变土地用途需取得的同意和签订的变更协议或重新签订合同的要求。
- 《中华人民共和国土地管理法》第五十六条：建设单位使用国有土地的，应当按照土地使用权出让等有偿使用合同的约定或者土地使用权划拨批准文件的规定使用土地；确需改变该幅土地建设用途的，应当经有关人民政府自然资源主管部门同意，报原批准用地的人民政府批准。
- 《中华人民共和国城乡规划法》第三十五条：城乡规划确定的各类用地禁止擅自改变用途，这包括商铺用地改为住宅用地。
- 《中华人民共和国民法典》第三百五十条：建设用地使用权人应当合理利用土地，不得改变土地用途；需要改变土地用途的，应当依法经有关行政主管部门批准。
总结与建议：商铺改成住房是否合法以及是否算自有住房，取决于多个因素的综合考量。在进行此类改造前，建议您务必咨询当地规划部门、房管部门或相关法律专业人士，了解具体的政策要求和审批流程。同时，确保改造行为符合建筑安全规范和相关技术标准，以保障居住安全和舒适性。如果您在改造过程中遇到任何法律问题或纠纷，也可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议和帮助。