在未办理施工许可擅自施工的处罚案例中，立案申请并非仅针对建设单位或施工单位单一方，而是可能同时涉及两者，具体取决于实际情况和法律规定。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

1. 法律责任主体

• 建设单位责任：根据《建设工程质量管理条例》等相关法律法规，建设单位作为工程项目的发起者和组织者，有义务在施工前办理施工许可证。若建设单位未办理施工许可证而擅自施工，将承担相应的法律责任。
• 施工单位责任：施工单位作为工程项目的实际执行者，同样有义务确保施工活动的合法性。若施工单位在明知未取得施工许可证的情况下仍进行施工，也将面临法律责任。

2. 立案申请的对象

• 同时立案：在发现未办理施工许可擅自施工的违法行为后，行政机关（如建设行政主管部门）通常会同时审查建设单位和施工单位的行为，并决定是否对两者同时立案。这是因为两者在违法行为中均可能扮演了重要角色。
• 单独立案：在某些特殊情况下，如仅能确定建设单位或施工单位中的一方存在违法行为，而另一方行为合法或无法确定其违法行为时，行政机关可能会仅对确定存在违法行为的一方进行立案。

3. 处罚措施

• 对建设单位的处罚：若建设单位未办理施工许可证而擅自施工，行政机关可能会责令其停止施工，限期改正，并处以罚款。罚款数额通常根据工程项目的规模、违法行为的严重程度等因素确定。
• 对施工单位的处罚：若施工单位在明知未取得施工许可证的情况下仍进行施工，行政机关同样会责令其停止施工，并可能处以罚款。此外，施工单位还可能面临其他行政处罚，如吊销资质证书等。

4. 实际案例中的处理

• 在实际案例中，行政机关通常会根据违法行为的实际情况和证据，对建设单位和施工单位进行综合审查，并决定是否对两者同时进行处罚。例如，若两者存在共同违法行为或相互勾结的情况，行政机关可能会对两者同时立案并处罚。

5. 法律建议

• 遵守法律法规：建设单位和施工单位均应严格遵守相关法律法规，确保在施工前办理好所有必要的许可手续。
• 加强沟通与协作：建设单位和施工单位在项目实施过程中应加强沟通与协作，共同确保施工活动的合法性和安全性。
• 及时咨询法律专业人士：若对施工许可等法律法规存在疑问或不确定如何操作时，应及时咨询法律专业人士以获取专业指导。

总结来看，在未办理施工许可擅自施工的处罚案例中，立案申请并非仅针对建设单位或施工单位单一方。行政机关会根据实际情况和法律规定，对两者进行综合审查并决定是否立案。因此，建设单位和施工单位均应严格遵守相关法律法规，确保施工活动的合法性和安全性。如有任何法律问题或疑虑，请直接向我咨询。