在解答您关于“土地更换只有双方写协议是否有效”的问题时，我们需要依据《中华人民共和国民法典》的相关规定来进行详细分析。
首先，结论前置：土地更换（或称为土地互换）双方签订的协议，在满足一定条件下是有效的。这些条件包括但不限于主体适格、意思表示真实、不违反法律法规的强制性规定和公序良俗，以及符合土地承包经营等相关规定。
接下来，我们详细分析这些条件：
主体适格：
- 参与土地互换的双方必须是具有完全民事行为能力的自然人、法人或非法人组织。这意味着双方必须能够独立承担民事责任，具备签订和履行合同的能力。
意思表示真实：
- 双方签订协议的意思表示必须是真实的，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。如果一方通过欺骗手段使另一方签订互换协议，受欺诈方有权主张合同无效或撤销。
合法性与合规性：
- 土地互换不能违反土地用途管制制度。例如，农用地只能用于农业生产相关用途，不能通过互换转为建设用地。
- 协议内容不能违背社会公共秩序和善良风俗，也不能损害他人、集体、国家的利益。
- 互换的土地必须是合法取得的，且不存在任何法律上的争议或限制。
土地承包经营特殊规定（如涉及农村土地）：
- 如果土地互换涉及农村土地承包经营权，那么互换应在同一集体经济组织内进行，因为农村土地承包经营权具有一定的身份属性。
- 土地承包经营权互换后，当事人应向发包方备案，虽然备案并非协议生效的必要条件，但有助于保障双方权益和管理土地承包情况。
无效情形：
- 如果不满足上述条件，土地互换协议可能无效。例如，协议内容违反法律、行政法规的强制性规定，或者一方以欺诈手段使对方在违背真实意思的情况下签订协议。
专业建议：
- 为确保协议的有效性和可执行性，建议在签订土地互换协议前咨询专业的律师或法律顾问。他们可以帮助审查协议内容，确保其符合法律法规要求，并避免潜在的法律风险。
综上所述，土地更换双方签订的协议在满足一系列法定条件时是有效的。这些条件涵盖了主体的民事行为能力、意思表示的真实性、合法性与合规性、土地承包经营的特殊规定等方面。只有在全面满足这些条件的情况下，双方签订的土地互换协议才具有法律效力。