两家交换土地的协议双方签字后，在满足一定条件下是有效的。以下从不同角度为您详细分析：
一、协议有效的基本条件
主体适格：
- 参与土地互换的双方必须具有完全民事行为能力，即能够独立进行民事活动，承担民事责任。例如，在农村土地承包经营权互换中，互换双方应为承包户，且承包户代表应具备相应的民事行为能力。
意思表示真实：
- 双方签订协议的意思表示必须是真实的，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。如果一方以欺诈手段使对方在违背真实意思的情况下签订协议，受欺诈方有权请求人民法院或仲裁机构撤销协议。
合法性与合规性：
- 土地互换不能违反土地用途管制制度，即农用地只能用于农业生产相关用途，不能通过互换转为建设用地。
- 协议内容不能违背社会公共秩序和善良风俗，也不能损害他人、集体、国家的利益。
- 互换的土地必须是合法取得的，且不存在任何法律上的争议或限制。
二、协议可能无效的情形
主体不适格：
- 如果一方对土地无合法权益，如土地非其承包经营却擅自与他人互换，该协议可能无效。
意思表示不真实：
- 如果合同的签订不是双方真实意愿的体现，如一方通过欺骗手段使另一方签订互换合同，受欺诈方有权主张合同无效或撤销。
内容违法：
- 如果土地互换违反了法律法规的强制性规定，如将基本农田用于非农业建设的互换协议，则自始无效。
程序不合法：
- 在一些情况下，土地互换可能需经过特定程序，如向发包方备案等。虽然备案不影响合同效力，但未经法定程序可能影响合同的稳定性和后续权益保障。如果未遵循相关程序，也可能导致协议无效或存在效力瑕疵。
三、法律建议
签订前审查：
- 在签订土地互换协议前，双方应仔细审查对方的身份和土地权属情况，确保主体适格和土地合法。
明确协议内容：
- 协议内容应明确具体，包括互换土地的位置、面积、四至界限、互换期限、互换方式等，以避免后续产生纠纷。
遵循法定程序：
- 如果土地互换需要经过特定程序，如向发包方备案等，双方应按照法定程序进行操作，以确保协议的合法性和有效性。
咨询专业律师：
- 为确保协议的有效性和可执行性，建议在签订土地互换协议前咨询专业的律师。我可以帮助审查协议内容，确保其符合法律法规要求，并避免潜在的法律风险。
两家交换土地的协议双方签字后是否有效，取决于多个关键因素。只有在全面满足主体适格、意思表示真实、合法性与合规性等条件的情况下，双方签订的土地互换协议才具有法律效力。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。