针对您提出的“劳动合同里有一条不给农村户口交公积金是否合法”的问题，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确的是，住房公积金制度是城镇住房制度改革的产物，其初衷是为了促进城镇住房建设，提高城镇居民的居住水平。对于农业户口在职职工是否应建立公积金账户，目前的法律法规并未作出明确规定。

具体来说，根据《住房公积金管理条例》以及《关于住房公积金管理若干具体问题的指导意见》的相关规定，农业户口职工缴存公积金遵循的是自愿原则。这意味着，单位和职工可以协商确定是否缴存公积金，如果协商不成，则不强制缴存。

然而，这并不意味着单位可以完全忽视农业户口职工的公积金权益。在有条件的地方，城镇单位聘用进城务工人员（包括农业户口职工）时，单位和职工是可以选择缴存住房公积金的。这体现了对农业户口职工权益的尊重和保护。

另外，如果职工的户口本已经改版为统一居民户口本，并标注为“家庭户”，那么单位应在户口类型变更后当月依法为职工开户缴存住房公积金。这一点也明确了在户口类型变更后，单位应承担的公积金缴存责任。

综上所述，劳动合同里规定不给农村户口职工交公积金，并不直接构成违法。但是，这并不意味着单位可以完全忽视农业户口职工的公积金权益。在协商不成的情况下，虽然不强制缴存，但单位应尊重职工的意愿，并在有条件的情况下积极为职工缴存公积金。同时，如果职工的户口类型发生变更，单位应及时依法为职工开户缴存住房公积金。

因此，我建议您先与单位进行协商，了解单位对于公积金缴存的具体政策和态度。如果协商无果，您可以考虑向当地的住房公积金管理中心进行咨询和投诉，以维护自己的合法权益。