针对您提出的“企业转租房屋可以开具租赁发票吗？合法吗？”这一问题，我将从税收法律法规、发票管理规定以及实际操作层面为您进行详细解答。
一、企业转租房屋开具租赁发票的合法性
首先，从税收法律法规的角度来看，企业转租房屋属于增值税应税行为。根据相关规定，企业发生应税行为即负有开具发票的义务。因此，企业在转租房屋时，为承租方开具房屋租赁发票是合法的，也是符合税收管理要求的。
二、开具租赁发票的条件与方式
自行开具：
- 如果企业经营范围中包含房屋租赁，或者虽然未包含但偶尔发生转租业务，企业可以自行开具租赁发票。
- 企业需先在税务机关进行发票票种核定，领取相应的发票开具设备和发票。
- 通过开票软件填写发票信息（包括承租方信息、租赁房屋信息、租金金额等）并打印，最后加盖发票专用章。
税务机关代开：
- 如果企业不具备自行开具发票的条件（如小规模纳税人等），或者由于其他原因无法自行开具，可以向当地税务机关申请代开发票。
- 申请代开时，需携带租赁合同、营业执照副本、经办人身份证等资料，并缴纳相关税款。
三、特殊情况与注意事项
经营范围变更：
- 如果企业经常发生转租业务，但经营范围中未包含房屋租赁，建议先到工商部门变更经营范围，以便更合规地开展业务。
与原始出租方的关系：
- 虽然转租方非房屋产权人，但与原始出租方之间的租赁关系和转租行为应合法有效。
- 在必要时，转租方可与原始出租方协商，由其直接向承租方开具发票并注明是代转租方收取的租金。但这种方式需得到原始出租方的同意，并可能涉及额外的税务处理。
发票类型与税率：
- 根据承租方的需求，可以选择开具增值税专用发票（适用于一般纳税人且有抵扣进项税额需求的情况）或增值税普通发票（适用于承租方为小规模纳税人、行政事业单位或个人等不需要抵扣进项税额的主体）。
- 税率方面，一般纳税人提供不动产租赁服务适用税率为9%（但若转租的房屋是2016年4月30日前取得的，可选择简易计税方法按5%的征收率计算应纳税额）；小规模纳税人按5%的征收率计算缴纳增值税。
合规性与风险防控：
- 无论自行开具还是代开，都必须确保交易的合法性、真实性和准确性。
- 应妥善保管好发票和相关票据，以备税务检查和财务报销之需。
- 针对部分地区税务局可能不允许使用分割单的情况（如江西省税务局回复企业转租房屋不适用外部分割单），建议及时与当地税务局做好沟通，确保合规操作。
四、结论与建议
综上所述，企业转租房屋时开具租赁发票是合法的，也是符合税收管理要求的。在实际操作中，企业应根据自身情况和业务需求选择合适的开票方式（自行开具或税务机关代开），并确保交易的合法性和合规性。同时，建议企业及时与当地税务局沟通，了解并遵守相关税收政策和规定，以降低税务风险。