小区车位必须按自然月收费并不一定违法，但具体是否合法需结合实际情况和相关法律法规进行综合判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 合同自由原则

• 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方当事人在不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗的前提下，有权自由约定合同的内容，包括收费方式。
• 分析：如果小区车位收费方式（如按自然月收费）已经在业主与物业公司签订的物业服务合同或车位使用协议中明确约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么这种收费方式就是合法的。

2. 地方性法规与规章

• 法律背景：不同地区可能根据本地实际情况制定了关于小区车位收费的地方性法规或规章。
• 分析：如果当地的地方性法规或规章对小区车位收费方式有具体规定（如必须按小时、按天或按自然月收费），则物业公司应遵守这些规定。若违反，则可能构成违法。但目前并无普遍适用的法律规定小区车位必须按自然月收费，因此需具体查看当地规定。

3. 合理性原则

• 法律背景：虽然合同自由原则允许双方约定收费方式，但这种约定也应遵循合理性原则，不得显失公平或侵犯业主的合法权益。
• 分析：如果按自然月收费的方式导致业主在不需要使用车位的情况下仍需支付全额费用，或者收费标准明显高于市场水平，那么这种收费方式可能因缺乏合理性而受到质疑。在此情况下，业主可以通过与物业公司协商、向相关部门投诉或寻求法律途径来维护自己的权益。

4. 实际操作中的建议

• 查看合同：首先，业主应查看自己与物业公司签订的物业服务合同或车位使用协议，了解其中关于车位收费方式的约定。
• 了解地方规定：其次，业主可以了解当地关于小区车位收费的地方性法规或规章，以判断物业公司的收费方式是否合法。
• 协商与投诉：如果业主认为物业公司的收费方式不合理或违法，可以与物业公司进行协商，或者向当地的房地产管理部门、物价部门等相关部门进行投诉。
• 法律途径：在协商和投诉无果的情况下，业主还可以考虑通过法律途径来维护自己的权益，如提起民事诉讼等。