结论：开发商协议中若约定七个自然日内打款，而未按时打款，则违约金的计算起始日通常为第八个自然日，但具体还需依据协议中的明确约定来确定。
详细分析
协议约定优先：
- 在处理此类问题时，首先应当查看开发商与购房者（或相关方）签订的协议中是否有关于违约金计算起始日的明确约定。如果协议中明确规定了违约金的计算起始日，那么应当按照协议中的规定来执行。
通常理解与法律实践：
- 若协议中未明确约定违约金的计算起始日，但约定了打款期限为七个自然日，那么从通常理解上，违约金的计算起始日应当为打款期限届满后的第一个自然日，即第八个自然日。这是因为，在打款期限内，开发商并未构成违约，只有当期限届满而未打款时，才构成违约。
- 在法律实践中，违约金的计算通常是从违约行为发生之日起开始计算的。因此，在没有特别约定的情况下，可以合理推断违约金的计算起始日为打款期限届满后的第一个自然日。
特殊情况考虑：
- 当然，也存在一些特殊情况。例如，协议中可能规定了某些宽限期或特殊条件下的违约金计算方式。在这种情况下，应当按照协议中的特殊规定来执行。
- 另外，如果双方对违约金的计算起始日存在争议，并且无法通过协商解决，那么可能需要通过法律途径来解决争议。在这种情况下，法院或仲裁机构将会根据相关法律法规和协议内容来作出裁决。
建议与后续行动
- 查看协议：首先，建议您仔细查看与开发商签订的协议，特别是关于打款期限和违约金计算的相关条款。
- 与开发商协商：如果发现协议中存在不明确或争议的地方，建议您及时与开发商进行协商，以寻求双方都能接受的解决方案。
- 寻求法律帮助：如果协商无果，或者您认为开发商的行为已经构成了严重违约，那么您可以考虑寻求法律帮助，通过法律途径来维护自己的合法权益。
在处理此类问题时，请务必保持冷静和理性，依据相关法律法规和协议内容来维护自己的权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。