结论前置：在工厂自离，工厂不应无故克扣你的工资。若想确保不被扣工资，关键在于了解法律规定、保留相关证据，并在必要时采取法律手段维权。以下从不同角度为你详细分析：
一、法律规定角度
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，即便你自离，只要付出了劳动，就有权获得相应的报酬。工厂不能以“自离”为由全额扣发你的工资。
同时，《工资支付暂行规定》第十六条也明确，若因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。
二、工厂可能扣工资的情形及应对
按旷工处理：
- 自离可能被视为旷工，工厂可能根据规章制度扣除相应天数的工资。但扣除的工资应仅限于你未提供劳动的天数，且扣除后的工资不得低于最低工资标准。
- 应对：保留好考勤记录等证据，证明你实际提供劳动的天数，以便在维权时使用。
工作交接未完成：
- 若自离导致项目延误、设备损坏或客户流失等损失，工厂可能要求你赔偿。但赔偿应基于实际损失，且不得超过你当月工资的20%。
- 应对：在自离前尽量完成工作交接，或与工厂协商赔偿事宜，避免不必要的纠纷。
其他合理费用：
- 如未归还工装、工具或造成财物损坏等，工厂可从工资中扣除相应费用。但扣除的费用应合理，且不得低于最低工资标准。
- 应对：在自离前归还所有财物，或与工厂协商扣除费用的金额。
三、维权途径
若工厂以自离为由扣发你的工资，你可以通过以下途径维权：
与工厂协商：
- 主动与工厂的人力资源部门或相关负责人联系，说明自离的具体原因，并指出工厂扣工资可能违反了法律规定。
- 注意：在沟通过程中，务必保留好所有交流记录，如邮件、短信、通话记录等，作为后续维权的证据。
向劳动监察部门投诉：
- 若协商无果，你可向当地劳动监察部门投诉。投诉时，需准备好劳动合同、工资条、考勤记录、离职证明等相关证据材料。
- 流程：详细说明自离原因及工厂扣工资的具体情况，并提交准备好的证据材料。劳动监察部门将依法对工厂进行调查处理。
申请劳动仲裁：
- 若对劳动监察部门的处理结果不满，你可在一年内（从知道或应当知道权利被侵害之日起计算）向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 准备材料：包括仲裁申请书、证据材料等。仲裁申请书需写明基本信息、仲裁请求、事实和理由等。
- 参加庭审：在仲裁庭审中清晰陈述诉求和事实依据，并对工厂的答辩进行回应。仲裁委员会将根据双方证据和陈述作出裁决。
提起诉讼：
- 若对仲裁裁决结果不服，你可在规定时间内向人民法院提起诉讼。但诉讼程序相对复杂且耗时，需谨慎考虑。
- 建议：考虑到诉讼的专业性和复杂性，建议你在必要时聘请律师代理诉讼，以提高胜诉几率。
四、避免类似情况再次发生
- 尽量按公司流程办理离职：减少不必要的纠纷，确保自己的权益不受损害。
- 了解并遵守公司规章制度：避免因违反规定而给工厂造成损失，从而引发赔偿纠纷。
- 保留好相关证据：如劳动合同、工资条、考勤记录等，以便在维权时使用。
总之，在工厂自离并不意味着工厂可以无故克扣你的工资。若遭遇此类情况，你应首先尝试与工厂沟通解决；若协商无果，可依次寻求内部调解、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁，乃至提起诉讼来维护自己的权益。如果你还有其他关于劳动工伤（工资福利）的法律问题，可以直接向我咨询。