针对您提出的问题“父亲租的店面，儿子办的营业执照，业主该告谁”，核心结论在于：业主起诉的对象取决于租赁合同和营业执照办理的具体情况，以及业主的诉求和证据情况。以下从不同角度进行分析：
一、租赁合同关系角度
若租赁合同是父亲与业主签订：
- 通常情况下，业主应基于租赁合同关系起诉父亲。因为租赁合同是父亲与业主之间就店面使用、租金支付等事项达成的协议，儿子办理营业执照的行为并不直接改变租赁合同的主体关系。
- 如果业主认为父亲违反了租赁合同的约定（如未按时支付租金、擅自转租等），业主有权依据租赁合同起诉父亲，要求其承担违约责任。
若租赁合同中有关于营业执照办理的特别约定：
- 如果租赁合同中明确规定了由谁（父亲或儿子）负责办理营业执照，以及未办理或违规办理的法律责任，那么业主可以根据合同约定起诉违约方。
- 例如，如果合同约定由父亲负责办理营业执照，但实际上是儿子办理的，且这一行为违反了合同约定或相关法律法规，业主可以起诉父亲承担违约责任。
二、营业执照办理与经营行为角度
若儿子以自己名义办理营业执照并实际经营：
- 如果儿子以自己的名义办理了营业执照，并实际在店面上进行经营活动，那么从经营行为的角度来看，儿子可能是实际的经营者。
- 如果业主认为儿子的经营行为侵犯了其权益（如噪音扰民、环境污染等），业主可以考虑起诉儿子，要求其停止侵权行为并承担相应的法律责任。但这一起诉通常需要基于具体的侵权行为和证据。
若儿子办理营业执照但未实际经营，或经营行为与父亲有关：
- 如果儿子虽然办理了营业执照，但并未实际进行经营活动，或者经营行为实际上是由父亲控制的，那么业主起诉的对象可能仍然是父亲。
- 在这种情况下，业主需要收集证据证明父亲是实际上的经营者或控制者，以便在诉讼中主张自己的权益。
三、综合考量与诉讼策略
- 业主的诉求和证据情况：业主在决定起诉谁时，应综合考虑自己的诉求（如要求支付租金、停止侵权行为等）和手头的证据情况。如果证据充分且明确指向某一方，业主可以选择起诉该方。
- 诉讼风险与成本：业主在起诉前还应评估诉讼的风险和成本。如果起诉对象不明确或证据不足，可能会导致诉讼失败或增加诉讼成本。因此，业主在决定起诉前应进行充分的法律分析和风险评估。
建议：业主在面临此类纠纷时，应首先收集相关证据（如租赁合同、营业执照、经营记录等），并咨询专业律师以获取具体的法律建议。律师可以根据具体情况帮助业主分析起诉对象、制定诉讼策略，并代表业主进行诉讼活动。如果您有进一步的法律问题或需要具体的法律建议，请直接向我咨询。