以父母名义注册营业执照但实际由儿子经营的情况下，所欠债务原则上由名义上的经营者即父母承担，但存在以下例外情形可能导致儿子承担或共同承担债务：

1. 名义经营者与实际经营者共同承担债务的情形
   根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第五十九条，在诉讼中，个体工商户以营业执照上登记的经营者为当事人。有字号的，以营业执照上登记的字号为当事人，但应同时注明该字号经营者的基本信息。营业执照上登记的经营者与实际经营者不一致时，以登记的经营者和实际经营者为共同诉讼人。
   这意味着，若债权人起诉要求偿还债务，父母（登记经营者）和儿子（实际经营者）可能被列为共同被告，法院可能判决双方共同承担还款责任。例如，若儿子以父母名义对外签订合同或出具欠条，债权人可主张双方构成“表见代理”或共同经营关系，从而要求共同担责。

2. 实际经营者单独承担债务的情形
   若能证明债务完全由儿子个人行为导致，且父母未参与经营、未从中受益，且债权人明知实际经营者为儿子，则可能由儿子单独承担债务。但实践中，此类证明难度较高，需满足以下条件：

   • 父母未参与任何经营决策或管理活动；
     
   • 儿子以个人名义对外签订合同、收取款项或出具债务凭证；
     
   • 债权人明确知晓实际经营者为儿子（如合同中注明儿子身份、款项汇入儿子账户等）。
     若缺乏上述证据，法院可能倾向于认定父母作为登记经营者需承担责任。

3. 家庭共同经营导致的连带责任
   若店铺收入用于家庭共同生活，或父母与儿子共同管理店铺（如父母负责财务、儿子负责采购），则债务可能被认定为家庭共同债务，父母与儿子需以家庭财产共同偿还。此时，债权人可主张“家庭经营”关系，要求全体家庭成员承担连带责任。

建议措施：

• 对父母而言：若未参与经营，应保留证据（如委托经营协议、儿子单独管理店铺的记录、资金往来明细等），证明自身与债务无关；
  
• 对儿子而言：若需继续经营，建议尽快办理营业执照变更，将经营者变更为自己，避免法律风险；
  
• 对债权人而言：起诉时可同时列父母和儿子为被告，并收集证据证明实际经营关系（如监控录像、员工证言、交易记录等），以增加胜诉概率。
  

如有具体案件细节（如债务形成过程、父母参与程度等），可进一步向我咨询，我会结合证据为您分析责任承担的具体比例。