在交通事故中，若双方被认定为同等责任，并且涉及商业三者险的赔偿，那么保险公司的赔偿标准会依据具体情况有所不同。以下是对这一问题的详细解答：
一、双方均为机动车的情况
交强险赔偿：
- 首先，由各自的交强险在责任限额内赔偿对方的损失。交强险的赔偿范围包括死亡伤残、医疗费用、财产损失等。
商业三者险赔偿：
- 超出交强险赔偿限额的部分，双方将按照50%的比例分担责任。
- 这部分责任将由各自的商业三者险进行赔偿。如果某一方没有购买商业三者险，那么超出交强险的部分将由该方自行承担。
二、一方为机动车，一方为非机动车或行人的情况
交强险赔偿：
- 机动车的交强险将首先进行赔偿，覆盖非机动车或行人的部分损失。
超出交强险部分的赔偿：
- 超出交强险赔偿限额的部分，机动车一方通常将承担约60%的赔偿责任，而非机动车或行人一方将承担约40%的责任。
- 这部分责任同样会通过商业三者险进行理赔。如果机动车一方没有购买商业三者险，那么超出交强险的部分将由机动车一方自行承担。
- 这样的规定是为了适当倾向保护非机动车和行人，因为他们在交通事故中通常处于更弱势的地位。
三、赔偿流程与注意事项
赔偿流程：
- 在事故发生后，首先应由交强险进行赔偿。
- 超出交强险限额的部分，再根据责任比例由商业三者险进行赔偿。
- 如果涉及诉讼，法院将根据事实和法律作出判决，确定具体的赔偿金额和责任分担。
注意事项：
- 保留好所有与事故相关的证据，如事故责任认定书、医疗费用票据、维修发票等。
- 在与保险公司或对方协商赔偿时，应明确赔偿项目和金额，并签订书面赔偿协议。
- 如果对赔偿标准或流程有疑问，可以咨询专业的法律人士或保险代理人。
四、其他赔偿项目
除了上述的财产损失和医疗费用外，交通事故中还可能涉及误工费、伤残赔偿金等赔偿项目。这些项目的计算方式和赔偿标准会根据具体情况和法律规定有所不同。
综上所述，在交通事故同等责任下，商业三者险的赔偿标准会根据双方是否为机动车以及具体的损失情况而有所不同。如果您对赔偿流程、具体金额核算等有更深入的疑问，建议咨询专业的法律人士或保险代理人以获取更精准的答案。