在案件立案后，若证据不足，依据《行政处罚法》第四十条不得给予行政处罚的，一般应按照以下方式结案：
终止案件调查：
- 当行政机关在立案后，经过审查发现证据不足以支持行政处罚时，应及时终止案件调查。这是基于行政合法性原则和证据充分性原则的要求，确保行政行为的合法性和合理性。
作出不予处罚决定：
- 根据《行政处罚法》的相关规定，行政机关在证据不足的情况下，不得给予行政处罚。因此，行政机关应作出不予处罚的决定，并明确告知当事人不予处罚的理由和依据。
保障当事人合法权益：
- 在作出终止案件调查或不予处罚决定前，行政机关应充分告知当事人相关权利和理由，确保当事人的知情权、参与权和申诉权得到保障。这有助于维护当事人的合法权益，增强行政行为的透明度和公信力。
遵循法定程序：
- 行政机关在处理证据不足的案件时，应严格遵循法定程序，包括调查取证、审查决定、告知送达等环节。确保整个处理过程合法合规，避免程序瑕疵导致的法律风险。
具体操作流程：
- 调查取证阶段：行政机关应依法进行调查取证，收集与案件相关的证据材料。若发现证据不足，应及时调整调查方向或补充证据。
- 审查决定阶段：行政机关应对收集到的证据进行审查，评估证据的充分性和合法性。若证据不足，应作出不予处罚的决定，并说明理由。
- 告知送达阶段：行政机关应将不予处罚的决定及时告知当事人，并送达相关法律文书。确保当事人了解处理结果和申诉途径。
注意事项：
- 行政机关在处理证据不足的案件时，应秉持严谨、公正的态度，不得随意作出对当事人不利的裁决。
- 若当事人对不予处罚的决定有异议，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。
法律后果：
- 若行政机关在证据不足的情况下违法给予行政处罚，可能面临行政复议被撤销、行政诉讼败诉等法律后果。同时，还可能对行政机关的公信力和形象造成负面影响。
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