在劳动仲裁中，若申请人将原件提交给了有两个被申请人的仲裁机构，且后续需要用到这些原件，可以按照以下步骤处理：
保留复印件：
- 向仲裁机构说明原件后续还有其他用途，询问能否复印一份存档。
- 得到许可后，复印好原件，并请仲裁机构在复印件上注明“此复印件与原件核对无异，原件由申请人[姓名]提交于本仲裁机构”，并加盖仲裁机构印章。这样做可以证明复印件的真实性和有效性，以便在需要时使用。
仲裁程序结束后的取回：
- 仲裁程序结束后，若仍需原件，要及时和仲裁机构联系取回。
- 取回时，务必办理签收手续，明确已取回原件，避免后续产生纠纷。
应对原件丢失的情况：
- 万一出现原件丢失的情况，要第一时间告知仲裁机构。
- 配合仲裁机构，补充提交相关说明或替代材料，如复印件、电子版或其他能证明事实的证据，以防止影响仲裁结果执行等后续事宜。
法律背景与建议：
- 在劳动仲裁过程中，提交原件是常见的做法，但申请人应意识到原件的重要性，并尽可能保留复印件或电子版以备不时之需。
- 若因特殊原因必须提交原件，且后续可能用到，应提前与仲裁机构沟通，了解并遵守其关于原件保管和取回的规定。
- 原件丢失可能带来严重的法律后果，如影响仲裁结果的执行、导致申请人承担举证不能的责任等。因此，申请人应妥善保管原件，并在发现丢失后立即采取补救措施。
可能的法律后果：
- 若因原件丢失导致无法提供关键证据，可能影响仲裁结果的公正性，甚至导致申请人败诉。
- 若申请人未按照仲裁机构的规定取回原件，或取回时未办理签收手续，可能引发后续的纠纷和争议。
举例说明：
假设小张因劳动纠纷向劳动仲裁机构申请仲裁，并提交了相关证据原件。在仲裁过程中，小张发现后续程序需要用到这些原件。于是，他向仲裁机构说明情况，希望取回原件或复印存档。仲裁机构同意了他的请求，并为他复印了证据，加盖了印章。仲裁程序结束后，小张及时联系仲裁机构取回了原件，并办理了签收手续。这样，小张就成功保障了原件的安全和后续使用。
总结与提醒：
在劳动仲裁中，提交原件需谨慎。若必须提交且后续可能用到，应提前与仲裁机构沟通并保留复印件。仲裁程序结束后，要及时取回原件并办理签收手续。若原件丢失，应立即告知仲裁机构并采取补救措施。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。