结论：用人单位因自身原因停工停产6天扣款414元是否合法，需结合具体工资结构、停工原因及地方规定综合判断，不能直接认定合法或非法。

一、法律框架与核心原则

根据《工资支付暂行规定》第十二条，非因劳动者原因造成单位停工、停产在一个工资支付周期内的，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资。超过一个工资支付周期的，若劳动者提供了正常劳动，支付工资不得低于当地最低工资标准；若未提供正常劳动，应按国家规定发放生活费。

关键点：

1. 停工原因：若因用人单位原因（如设备故障、订单不足）停工，劳动者未提供劳动时，用人单位仍需支付工资或生活费。
2. 工资支付周期：通常以月为单位，停工6天未超过一个周期，应全额支付工资。
3. 扣款合法性：未经劳动者同意，用人单位不得单方面扣减工资，除非符合法定情形（如违纪、赔偿损失等）。

二、扣款合法性分析

1. 若停工6天未超过一个工资支付周期：

   • 用人单位应全额支付当月工资，扣款414元缺乏法律依据，属于违法行为。
   • 法律依据：《工资支付暂行规定》第十二条。

2. 若停工6天跨越两个工资支付周期：

   • 第一个周期内应全额支付工资；第二个周期若未提供劳动，可按地方规定发放生活费（通常为最低工资的70%-80%）。
   • 若扣款414元后实发工资低于生活费标准，则违法。

3. 地方规定差异：

   • 部分地区（如江苏、广东）明确停工期间工资支付标准，需结合当地规定判断。例如，广东省规定停工不超过一个周期的，按劳动合同支付工资；超过的，按不低于当地最低工资80%支付生活费。

三、劳动者维权建议

1. 核查工资结构：

   • 确认月工资构成（如基本工资、绩效、补贴等），停工期间是否应全额发放基本工资。
   • 示例：若月工资5000元（基本工资3000元+绩效2000元），停工期间应至少发放基本工资3000元，扣款414元后若低于此标准，则违法。

2. 收集证据：

   • 劳动合同、工资条、停工通知、扣款记录等。
   • 作用：证明用人单位存在扣款行为及停工事实。

3. 协商与投诉：

   • 与用人单位协商要求补发工资；
   • 向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁。

四、计算公式（若需量化）

假设月工资为\(W\)元，停工6天未超过一个周期：

• 应发工资：\(W\)元（全额支付）；
• 实发工资：\(W - 414\)元；
• 合法性判断：若\(W - 414 < W\)（即扣款后低于全额），则违法。

示例：若月工资5000元，扣款414元后实发4586元，仍低于全额5000元，违法。

五、特殊情形

1. 劳动者过错：

   • 若停工因劳动者严重违纪（如故意损坏设备），用人单位可依据规章制度扣款，但需证明过错与扣款的因果关系。

2. 双方约定：

   • 若劳动合同或规章制度明确停工期间工资支付标准（如按实际出勤发放），且不违反法律强制性规定，可能被认可。但“扣款”表述需谨慎，避免被认定为克扣工资。

总结：用人单位因自身原因停工停产6天扣款414元，大概率不合法。建议劳动者先核查工资结构及地方规定，再通过协商或法律途径维权。如有疑问，可直接向我咨询具体案例。