当事人不申请回避，代理人一般不可以单独提起合议庭回避。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、法律原则与规定
在司法程序中，回避制度是为了确保审判的公正性和客观性而设立的。根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释的规定，当事人有权申请审判人员、书记员、翻译人员、鉴定人、勘验人等回避。这一权利通常由当事人本人行使，因为回避申请往往与当事人的直接利益相关，且涉及当事人对审判人员公正性的主观判断。
二、代理人权限与限制
代理人作为当事人的法律代表，其权限来源于当事人的授权。在民事诉讼中，代理人的权限通常包括代为起诉、应诉、承认、放弃、变更诉讼请求，进行和解，提起反诉或者上诉等。然而，关于回避申请的权限，法律并未明确赋予代理人单独提起的权利。这是因为回避申请涉及当事人对审判人员公正性的主观评价，这种评价往往与当事人的个人感受和利益直接相关，难以由代理人完全代为行使。
三、特殊情况下的处理
尽管一般情况下代理人不能单独提起合议庭回避，但在某些特殊情况下，如果当事人因客观原因无法亲自提出回避申请（如当事人死亡、丧失行为能力等），且代理人能够证明回避事由的存在且该事由可能影响审判的公正性，那么代理人可能会在获得法院许可的情况下，代为提出回避申请。不过，这种情况属于例外，并非普遍规则。
四、法律建议与后果
建议当事人亲自行使回避申请权：为了确保回避申请的有效性和及时性，建议当事人亲自行使这一权利。如果当事人确实无法亲自提出，可以考虑通过书面形式授权代理人代为提出，并明确说明回避事由和依据。
代理人应谨慎行使代理权：作为代理人，在行使代理权时应严格遵守法律规定和当事人的授权范围。对于回避申请等涉及当事人重大利益的事项，应谨慎处理，避免因越权行使而给当事人带来不利后果。
法律后果：如果代理人未经当事人授权或超越授权范围单独提起合议庭回避，可能会面临法院不予受理或驳回申请的风险。此外，如果因此给当事人造成损失的，代理人还可能承担相应的法律责任。