承包收益归发包商是否合法，需视具体情况而定，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
合法情形
合同明确约定：
- 如果承包合同中明确约定了承包收益归发包商所有，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么这种约定是合法的。因为合同是双方意思自治的体现，只要不违反法律强制性规定，双方应当按照合同约定履行。
- 例如，在某些特定的承包项目中，发包商可能为了控制项目风险或确保项目质量，而与承包商约定承包收益归发包商所有，同时给予承包商其他形式的补偿或激励。这种情况下，只要双方达成一致，且合同内容合法，就是有效的。
法律特别规定：
- 在某些特定领域或行业，法律可能特别规定承包收益归发包商所有。例如，在某些资源开发项目中，法律可能规定资源开发收益归国家或特定主体所有，而发包商作为国家或特定主体的代表，自然有权收取承包收益。
- 这种情况下，承包收益归发包商所有是合法的，因为这是法律特别规定的结果。
不合法情形
合同未约定或约定不明确：
- 如果承包合同中没有明确约定承包收益的归属，或者约定不明确，那么根据《民法典》等相关法律规定，承包收益通常应当归承包商所有。因为承包商是实际进行承包活动并承担风险的一方，其应当享有承包活动所产生的收益。
- 在这种情况下，如果发包商擅自收取承包收益，就可能构成对承包商财产权的侵犯，是不合法的。
违反法律强制性规定：
- 如果承包合同中的约定违反了法律、行政法规的强制性规定，或者违背了公序良俗，那么这种约定是无效的。例如，如果合同约定承包收益归发包商所有，但发包商并未提供任何对价或补偿，且该约定明显不公平、不合理，那么这种约定就可能被认定为无效。
- 在这种情况下，承包收益归发包商所有就是不合法的。
建议与风险提示
- 审查合同条款：在签订承包合同时，双方应当仔细审查合同条款，明确约定承包收益的归属以及其他相关事项。这有助于避免后续纠纷的发生。
- 遵守法律规定：双方应当遵守法律、行政法规的强制性规定，不得违背公序良俗。如果合同中的约定违反了法律规定，那么这种约定就是无效的，双方应当承担相应的法律责任。
- 及时咨询律师：如果在承包过程中遇到任何法律问题或纠纷，建议及时咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供法律意见和帮助，维护当事人的合法权益。
如果有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况提供详细的法律意见和帮助。