针对员工诉混同用工并要求两个公司承担连带责任的情况，公司若想举证证明两个公司为独立的个体，可以从以下几个方面进行举证：
一、公司法人资格独立性的举证
营业执照与注册信息：
- 提供两个公司的营业执照，证明它们各自具有独立的法人资格。
- 展示两个公司的注册信息，包括但不限于公司名称、注册地址、注册资本、法定代表人等，以证明它们是两个不同的法律实体。
公司章程与内部管理制度：
- 提交两个公司的章程，展示它们各自的组织架构、管理方式和决策机制，证明它们在内部管理上是独立的。
- 提供两个公司的内部管理制度文件，如财务管理制度、人事管理制度等，以进一步证明它们在运营上的独立性。
二、财务独立性的举证
财务报表与审计报告：
- 提供两个公司各自的财务报表，包括资产负债表、利润表、现金流量表等，以证明它们在财务上是独立的。
- 提交两个公司的审计报告，由独立的会计师事务所出具，证明它们的财务状况和经营成果是真实、准确的，且相互之间没有财务混同。
银行账户与交易记录：
- 展示两个公司各自的银行账户信息，包括开户行、账号等，以证明它们在资金上是独立的。
- 提供两个公司之间的交易记录，如采购合同、销售合同、付款凭证等，以证明它们之间的交易是按照市场原则进行的，没有不合理的资金往来。
三、业务与人员独立性的举证
业务范围与合同：
- 明确两个公司的业务范围，提供业务合同、项目合同等文件，证明它们在业务上是独立的，没有重叠或混淆。
- 展示两个公司与客户、供应商之间的交易记录，以证明它们在市场上的行为是独立的。
人员配置与劳动合同：
- 提供两个公司的人员配置情况，包括员工名单、职位、工作职责等，以证明它们在人员上是独立的。
- 提交两个公司员工的劳动合同，证明员工是与各自的公司签订的劳动合同，而不是与两个公司共同签订。
四、法律责任与诉讼行为的举证
法律责任承担：
- 强调两个公司在法律上的独立责任，即一个公司的法律责任不应由另一个公司承担。
- 提供相关法律法规和司法解释，支持两个公司在法律上的独立性。
诉讼行为独立性：
- 展示两个公司在诉讼中的独立行为，如各自委托的律师、提交的诉讼材料等，以证明它们在诉讼上是独立的。
- 如果可能，提供两个公司在诉讼中的和解协议或判决文书，以进一步证明它们在法律上的独立性。
法律建议与后果
- 法律建议：在举证过程中，公司应确保所有提供的证据都是真实、合法、有效的，并且能够形成完整的证据链，以证明两个公司的独立性。同时，公司应积极配合仲裁机构或法院的调查和审理工作，及时提供所需的证据和材料。
- 法律后果：如果公司能够成功举证证明两个公司为独立的个体，那么员工要求两个公司承担连带责任的诉求将可能被驳回。反之，如果公司无法提供充分的证据证明两个公司的独立性，那么员工的要求可能会得到支持，两个公司可能需要共同承担相应的法律责任。
在实际操作中，每个案件的具体情况都有所不同，因此公司应根据自身情况制定具体的举证策略。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。