民间借贷中扣押房产证是不合法的。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、法律角度
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，不动产的所有权以登记为准，房产证是房屋产权的重要凭证。债权人虽可能因借贷关系对债务人有一定权利，但私自扣押房产证侵犯了债务人对房产的相关权益，属于无权占有。债务人有权要求债权人返还房产证。若因借贷产生纠纷，债权人应通过合法途径解决，比如向法院起诉，通过财产保全等法律程序来保障自身债权，而不是擅自扣押房产证。
二、实际操作角度
协商解决：
- 当事人可先与对方协商，要求其返还房产证，并说明其扣押行为无合法依据。
法律途径：
- 若协商不成，当事人可收集能证明借贷关系及对方扣押房产证的证据，如借条、转账记录、聊天记录等，然后向人民法院提起诉讼，要求对方返还房产证。
- 法院会依据事实和法律作出判决，若对方仍不履行，当事人可通过强制执行程序要求其返还。
三、风险与后果
对债权人的风险：
- 债权人私自扣押房产证可能面临法律责任，包括因侵权行为而承担的赔偿责任。
- 若债权人拒不返还房产证，债务人可通过向法院提起物权保护之诉等，要求判令债权人返还房产证，以维护自身合法权益。
对债务人的影响：
- 虽然扣押房产证不影响房屋产权，但会给债务人带来诸多不便，如无法正常进行房屋交易、抵押等。
- 债务人应积极采取措施，要求债权人返还房产证，以维护自身权益。
四、建议与措施
增强法律意识：
- 借贷双方应增强法律意识，明确各自的权利和义务，避免采取非法手段解决纠纷。
完善合同内容：
- 无论选择押房产证还是不押房产证，借贷双方都应签订详细、合法的借款合同，明确双方权利义务，为可能出现的纠纷提供法律依据。
办理登记手续：
- 若决定以房产作为抵押，务必前往相关部门办理抵押登记手续，以确保权益得到更好保护。
总结与提醒：
民间借贷中扣押房产证是不合法的行为，债权人应通过合法途径维护自身权益。债务人若遭遇房产证被扣押的情况，应积极采取措施要求返还，并可通过法律途径解决纠纷。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。