考勤工资可以单独计算，但需结合具体情形和法律规定来综合判断。以下是详细分析：

1. 从劳动合同约定角度
   若劳动合同中明确约定了考勤工资的计算方式（如按实际出勤天数、迟到早退扣款规则等），且该约定不违反法律强制性规定（如最低工资标准），则用人单位可以单独计算考勤工资。例如，合同约定“月工资=基本工资2000元+绩效工资1000元，其中基本工资按实际出勤天数折算”，此时考勤工资（基本工资部分）可单独计算。

2. 从工资支付规定角度
   根据《工资支付暂行规定》，用人单位应按劳动合同约定的工资支付周期和标准支付工资。若考勤结果直接影响工资数额（如缺勤扣款），用人单位需在工资条中明确列示考勤扣款项目及金额，并确保扣除后的工资不低于当地最低工资标准。例如，员工月工资5000元，因缺勤3天扣款600元（按日工资200元计算），则实际发放4400元需符合最低工资要求。

3. 从法律限制角度
   单独计算考勤工资时，用人单位不得以“考勤不达标”为由克扣法定福利或奖金。例如，年终奖、加班费等不应因考勤问题被随意扣除，除非劳动合同或规章制度中有明确约定且经过民主程序公示。此外，若考勤制度存在不合理性（如要求员工24小时待命但未支付加班费），单独计算考勤工资可能被认定为违法。

建议：

• 用人单位应确保考勤制度合法合规，并在劳动合同或规章制度中明确考勤与工资的挂钩规则；
  
• 劳动者若发现考勤工资计算违法（如扣除后低于最低工资、未支付加班费等），可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
  

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