员工没有提交资料，公司给予5天年假这一做法是否合法，需分情况讨论：

1. 若公司规章制度或劳动合同中有明确规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，用人单位有权根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平，同样地，对于年休假等福利的安排，若公司规章制度或劳动合同中明确规定了员工未提交某些资料时，公司有权给予一定天数的年假作为调整或处理方式，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司给予5天年假的做法是合法的。
   • 关键点：规章制度或劳动合同的条款必须合法、合理，且已向员工公示或告知，员工对此有明确的认知。

2. 若公司规章制度或劳动合同中无相关规定：

   • 在没有明确规章制度或劳动合同约定的情况下，公司单方面因员工未提交资料而给予5天年假，可能缺乏法律依据。年休假通常是员工根据工作年限和法律规定享有的权利，而非公司可以随意调整或剥夺的福利。
   • 法律后果：若公司此举被认定为不合理或违法，员工有权要求公司按照法律规定或劳动合同约定执行年休假制度，甚至可能因此引发劳动争议。

3. 从员工权益保护角度：

   • 员工应了解自己的合法权益，包括年休假、工资福利等。若公司因员工未提交资料而擅自调整年休假，员工有权提出异议，并要求公司按照法律规定或劳动合同约定执行。
   • 建议：员工在遇到此类情况时，可以先与公司沟通协商，了解公司给予年假的具体原因和依据。若协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

4. 从公司管理角度：

   • 公司应制定合法、合理的规章制度，并明确告知员工。在处理员工未提交资料等问题时，应遵循法律法规和劳动合同约定，避免因处理不当而引发劳动争议。
   • 建议：公司可以通过完善内部管理制度、加强员工培训等方式，提高员工对规章制度的认知度和遵守度，从而减少类似问题的发生。

总结与建议：员工没有提交资料，公司给予5天年假是否合法，取决于公司规章制度或劳动合同中是否有明确规定。若规定合法且合理，则公司做法合法；若无规定或规定不合法，则公司做法可能违法。员工应了解自己的合法权益，并在遇到问题时及时与公司沟通协商或寻求法律援助。公司应制定合法、合理的规章制度，并加强员工培训和管理，以减少劳动争议的发生。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。