可以申请劳动仲裁来维护自己的权益，但直接以“公司强制取消底薪改成计件制”为由离职并主张经济补偿，需视具体情况而定。以下从不同角度为你详细分析：
一、公司行为合法性分析
劳动合同变更：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，劳动合同的变更（包括工资结构的变更）应当遵循平等自愿、协商一致的原则。如果公司未经你同意，单方面强制取消底薪并改成计件制，这可能构成违法变更劳动合同。
最低工资保障：
- 即使实行计件工资制，公司也应确保你的工资不低于当地的最低工资标准。如果计件工资低于最低工资标准，公司的行为就是违法的。
二、离职与经济补偿
被迫离职：
- 如果公司强制取消底薪并改成计件制，且这种变更导致你的工资大幅下降，低于最低工资标准或严重影响你的生活，你可以视为公司未按照劳动合同约定提供劳动条件，从而被迫提出离职。在这种情况下，你有权要求公司支付经济补偿。
经济补偿计算：
- 经济补偿的计算通常依据你在公司的工作年限和离职前的平均工资。具体公式为：经济补偿 = 工作年限 × 离职前12个月的平均工资。如果公司存在违法情形，你还有权要求支付赔偿金，赔偿金通常是经济补偿的两倍。
三、劳动仲裁流程与建议
收集证据：
- 在申请劳动仲裁前，你需要收集相关证据，如劳动合同、工资条、公司变更工资结构的通知等，以证明公司的行为违法。
申请劳动仲裁：
- 你可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求公司恢复原工资结构或支付经济补偿。在申请时，你需要提交仲裁申请书和相关证据。
寻求法律帮助：
- 如果你对劳动仲裁流程不熟悉或担心自己的权益得不到保障，可以寻求专业律师的帮助。律师可以为你提供法律咨询、代理仲裁等服务。
四、注意事项
- 及时行动：一旦发现公司存在违法行为，应及时采取行动，避免超过劳动仲裁的时效期限。
- 保持冷静：在处理劳动纠纷时，应保持冷静和理性，避免采取过激行为。
- 了解法律：在申请劳动仲裁前，应了解相关法律法规和政策，以便更好地维护自己的权益。
如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供更详细的法律建议和指导。