结论：在法定代表人借款不还的情况下，能否申请保全其名下公司账户，需分情况讨论，具体如下：

1. 若借款行为属于法定代表人个人行为，与公司无关
   根据《民法典》及相关司法解释，若法定代表人以个人名义借款，且借款未用于公司经营，也未获得公司授权或事后追认，则该债务属于个人债务。此时，原则上不能直接申请保全公司账户，因为公司并非债务人。但若存在以下特殊情形，可能突破公司独立责任：

   • 财产混同：若法定代表人将公司财产与个人财产混同（如通过个人账户收取公司款项、公司资金随意用于个人消费），且无法区分，债权人可依据《公司法》第二十条“法人人格否认”制度，主张公司承担连带责任，进而申请保全公司账户。
     
   • 恶意转移财产：若法定代表人为逃避债务，将个人财产无偿或低价转移至公司名下，债权人可依据《民法典》第五百三十九条“债权人撤销权”制度，请求法院撤销该转移行为，并保全相关财产（包括公司账户）。
     

2. 若借款行为属于职务行为或表见代理，公司可能承担责任
   若法定代表人以公司名义借款（如加盖公司公章、借款用于公司经营），或虽以个人名义但相对方有理由相信其代表公司（如表见代理），则公司可能成为共同债务人或承担替代责任。此时，债权人可直接申请保全公司账户，因为公司是债务人之一。

3. 实务建议

   • 证据收集：需重点收集借款合同、转账记录、用途证明（如发票、采购合同）、公司授权文件等，以证明借款性质（个人/职务）及财产混同情况。
     
   • 程序选择：若拟保全公司账户，需在起诉时同时申请财产保全，或起诉后申请诉中保全，并提供等值担保（如保险公司保函）。
     
   • 风险提示：若错误保全公司账户，可能面临公司反诉赔偿损失，因此需严格依据证据和法律申请。
     

总结：能否保全公司账户，核心在于判断借款是法定代表人个人行为还是公司行为，以及是否存在财产混同或恶意转移财产的情形。建议根据具体证据和法律关系，制定针对性策略。如有进一步疑问，可直接向我咨询。