行政机关已经对违建进行处理后，一般情况下，不能再以提起民事诉讼的方式就同一违建问题进行处理。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、行政处理与民事诉讼的区分
行政机关对违建的处理，通常基于其行政职权，依据相关行政法规（如《土地管理法》、《城乡规划法》等）进行。这种处理具有行政强制性，旨在维护公共利益和社会秩序。而民事诉讼则是公民、法人或其他组织之间因民事权益争议而提起的诉讼，其目的在于解决私人之间的权益纠纷。
二、行政处理后的民事诉讼可能性
就违建本身提起民事诉讼的排除：
- 一旦行政机关已经对违建进行了处理（如责令拆除、恢复原状等），并且该处理决定已经生效或执行，那么通常就不能再就同一违建问题提起民事诉讼。因为行政处理已经对违建问题作出了权威性的判定和处理，民事诉讼无法再对此进行重复处理。
因违建引发的其他民事权益争议：
- 如果违建问题引发了其他民事权益争议（如因违建导致的相邻权侵害、财产损失等），那么在这些争议未得到解决的情况下，相关当事人仍然可以提起民事诉讼。但需要注意的是，这种民事诉讼的焦点应当是违建引发的其他民事权益争议，而非违建本身。
三、法律建议
尊重行政处理决定：
- 如果行政机关已经对违建进行了处理，并且该处理决定已经生效或执行，那么相关当事人应当尊重并执行该决定。如果认为行政处理决定存在错误或不当，可以通过行政复议或行政诉讼等法律途径进行救济。
合理选择民事诉讼途径：
- 如果因违建问题引发了其他民事权益争议，并且这些争议未得到解决，那么相关当事人可以选择提起民事诉讼来维护自己的合法权益。但在提起民事诉讼时，应当明确诉讼的焦点和目的，避免与行政处理决定产生冲突或重复。
四、可能的法律后果
重复诉讼的风险：
- 如果在行政机关已经对违建进行处理后，仍然就同一违建问题提起民事诉讼，那么可能会面临重复诉讼的风险。法院可能会以“一事不再理”原则为由，驳回起诉或不予受理。
浪费司法资源：
- 重复提起民事诉讼不仅无法有效解决问题，还会浪费司法资源。因此，相关当事人应当合理选择法律途径来维护自己的合法权益。
综上所述，行政机关已经对违建进行处理后，一般情况下不能再以提起民事诉讼的方式就同一违建问题进行处理。但如果是因违建引发的其他民事权益争议，相关当事人仍然可以提起民事诉讼。在处理此类问题时，建议相关当事人尊重行政处理决定，并合理选择法律途径来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。