在借款合同纠纷中，若已经收取了高利息，处理方式需严格依据合同约定及法律规定来进行。以下是对此问题的详细解答：
一、高利息的认定与处理原则
首先，我们需要明确什么是“高利息”。根据相关法律规定，借款合同中约定的利率若超过合同成立时一年期贷款市场报价利率（LPR）的四倍，则超出部分被视为高利息，这部分利息是不受法律保护的。
二、已收取高利息的具体处理
超出LPR四倍的部分：
- 如果已经收取的利息超出了LPR的四倍，那么超出部分应当视为无效。借款人有权请求出借人返还这部分超额利息，法院也会予以支持。
年利率24%至36%之间的利息：
- 在这个区间内的利息，被称为自然债务区。如果这部分利息已经支付，那么出借人无需返还；但如果尚未支付，借款人则有权不支付。
年利率超过36%的部分：
- 这部分利息是绝对无效的。无论是否已经支付，借款人都有权请求出借人返还。
三、实际操作建议
核对合同与利率：
- 借款人应首先核对借款合同中的利率约定，确认是否超出了法律规定的上限。
与出借人协商：
- 如果发现已经收取了高利息，借款人可以尝试与出借人进行友好协商，请求返还超额部分。
寻求法律帮助：
- 如果协商无果，借款人可以寻求法律帮助，比如向人民调解委员会申请调解，或者向法院提起诉讼。在诉讼过程中，借款人需要提供充足的证据来支持自己的主张，比如借款合同、付款凭证等。
四、预防措施
为了避免类似纠纷的发生，借款人在签订借款合同时应特别注意以下几点：
明确利率约定：
- 在合同中明确约定借款利率，并确保该利率不超过法律规定的上限。
保留相关证据：
- 保留好与借款相关的所有证据，比如合同、转账记录、聊天记录等，以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。
了解法律规定：
- 在签订合同前，借款人应充分了解相关法律规定，确保自己的行为合法有效。
综上所述，在借款合同纠纷中，如果已经收取了高利息，借款人应根据法律规定和合同约定来处理。通过友好协商、人民调解或法律诉讼等方式来维护自己的合法权益。同时，借款人也应在签订合同时注意相关事项，以避免类似纠纷的发生。