针对您提出的“公司超过两年未与员工签订劳动协议怎么赔偿”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。这一规定旨在保护劳动者的合法权益，确保他们能够获得应有的劳动报酬和权益保障。
对于您提到的“超过两年未签订劳动合同”的情况，赔偿问题需要分阶段来考虑：
入职起1个月以上不满1年未签订合同：
- 在此期间，用人单位应支付双倍工资作为赔偿。具体计算期限是从用工之日起满一个月的次日开始，至补订书面劳动合同的前一日为止。例如，若您2022年1月1日入职，公司直到2022年5月1日才签订书面劳动合同，则公司需支付2022年2月1日至2022年4月30日期间的双倍工资。
入职满1年仍未签订合同：
- 根据法律规定，用人单位自用工之日起满一年不与劳动者订立书面劳动合同的，视为双方已订立无固定期限劳动合同。此时，虽然不再有双倍工资的赔偿，但您的劳动关系已经转化为无固定期限劳动合同，享有相应的权益保障。
- 需要注意的是，即使视为无固定期限劳动合同，您在满一年后至补签合同前的加班等行为，仍可按法律规定要求用人单位支付加班费等相关费用。
超过2年的情况：
- 对于超过两年未签订劳动合同的情况，双倍工资的赔偿可能受到仲裁时效的限制。一般来说，仲裁时效为一年，即自用工之日起满一年后的次日开始计算的一年内，您应主张权利。若超过此期间未主张，可能因仲裁时效过期而无法获得双倍工资赔偿。
- 然而，尽管双倍工资的赔偿可能受到限制，但您仍然享有无固定期限劳动合同的权益。您可以要求用人单位继续履行该合同约定的权利和义务，包括但不限于支付劳动报酬、提供劳动条件等。
实际操作建议：
- 面对此类情况，我建议您首先尝试与用人单位协商解决赔偿及合同签订问题。通过友好沟通，可能能够达成双方都能接受的解决方案。
- 若协商不成，您可以收集劳动关系证据（如工资支付凭证、工作证、考勤记录等），向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以维护自身权益。
- 在整个过程中，您也可以咨询专业律师或当地劳动监察部门，以获取更具体的法律建议和帮助。
总之，公司超过两年未与员工签订劳动协议是违反《劳动合同法》的行为，您有权要求公司承担相应的法律责任。希望以上解答能够对您有所帮助。