工厂发生安全事故后，工人的工资通常不会被扣，但具体情况需根据事故原因、责任归属及劳动合同或工厂规章制度的约定来判断。以下从不同角度为您详细分析：

1. 工厂责任导致的事故

• 工资支付义务：若事故由工厂管理不善、设备故障或违反安全生产规定等原因导致，工厂需承担全部或主要责任。根据《中华人民共和国劳动法》和《工资支付暂行规定》，工厂应按时足额支付工人工资，不得因事故停产而克扣。
• 例外情形：若劳动合同或工厂规章制度中明确约定“因工厂原因停产期间工资支付标准”（如按最低工资的80%支付生活费），且该约定不违反法律强制性规定，则工厂可按约定执行。但此类约定需经工人同意或通过民主程序制定，否则可能被认定为无效。

2. 工人责任导致的事故

• 过错责任：若事故因工人违规操作、故意破坏设备等个人原因导致，工厂可能根据规章制度对工人进行纪律处分（如警告、记过），甚至解除劳动合同。但工资扣除需严格限制：
  • 扣除范围：仅可扣除事故造成的直接经济损失（如设备维修费用），且扣除部分不得超过工人当月工资的20%，剩余工资不得低于当地最低工资标准。
  • 程序要求：工厂需举证证明损失与工人过错存在直接因果关系，并通知工人扣除理由及金额。

3. 不可抗力或第三方责任导致的事故

• 不可抗力：如自然灾害、政府行为等不可抗力导致停产，工厂通常无需支付停产期间工资，但需按当地规定支付生活费（如最低工资的70%-80%）。
• 第三方责任：若事故由第三方（如供应商、承包商）导致，工厂可向第三方追偿，但不得以此为由克扣工人工资。

4. 法律建议

• 保留证据：若工厂以事故为由扣发工资，工人应要求工厂出具书面通知，并保留劳动合同、工资条、事故报告等证据。
• 协商与投诉：可先与工厂协商解决；协商不成，可向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁，主张工资差额及赔偿。
• 注意时效：劳动争议申请仲裁的时效为1年，自知道或应当知道权利被侵害之日起计算。

5. 典型案例参考

• 案例1：某工厂因设备老化发生爆炸，停产3个月。法院判决工厂按原工资标准支付工人停产期间工资，因工厂未举证证明损失与工人过错有关。
• 案例2：工人违规操作导致事故，工厂扣除其当月工资的15%作为赔偿，法院认定扣除比例合法，但要求工厂补足低于最低工资标准的部分。

总结：工厂发生安全事故后，工人工资是否被扣需结合事故原因、责任归属及合同约定综合判断。若工厂无正当理由扣发工资，工人可通过法律途径维权。如有具体问题，可直接向我咨询。