结论：员工在上班途中发生交通事故且已自动离职的情况下，是否可仲裁要求企业赔付费用，需根据具体情况判断，主要包括是否构成工伤、企业是否存在过错以及是否已过仲裁时效等因素。

一、是否构成工伤

1. 构成工伤的情况：

   • 根据《工伤保险条例》第十四条第六项规定，员工在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的，应当认定为工伤。
   • 若员工在上班途中发生的交通事故非本人主要责任，且已认定为工伤，那么即使员工已自动离职，仍可享受工伤保险待遇，包括医疗费用、伤残补助等。此时，员工可通过劳动仲裁要求企业支付相应的工伤保险待遇。

2. 不构成工伤的情况：

   • 若员工在上班途中发生的交通事故系本人主要责任或全部责任，则不构成工伤。
   • 在不构成工伤的情况下，员工已自动离职，通常无法通过劳动仲裁要求企业赔付与交通事故相关的费用。

二、企业是否存在过错

1. 企业存在过错的情况：

   • 若企业存在未提供安全的工作环境、未履行安全保障义务等过错，且该过错与员工发生的交通事故存在因果关系，员工可能有权要求企业承担相应的赔偿责任。
   • 但这种情况下，员工需要证明企业的过错与交通事故之间的因果关系，这通常较为困难。

2. 企业无过错的情况：

   • 若企业已尽到安全保障义务，且员工发生的交通事故与企业无关，则企业无需承担赔偿责任。

三、是否已过仲裁时效

• 根据《劳动争议调解仲裁法》第二十七条规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
• 若员工在发生交通事故后未及时申请仲裁，且已超过一年的仲裁时效期间，则可能丧失通过劳动仲裁要求企业赔付费用的权利。

法律建议

1. 及时申请工伤认定：员工在发生交通事故后，应尽快向当地社会保险行政部门申请工伤认定，以确定是否构成工伤。
2. 收集证据：员工应收集与交通事故相关的证据，如交通事故责任认定书、医疗费用发票等，以证明其损失。
3. 咨询专业律师：由于劳动仲裁涉及复杂的法律程序和证据规则，员工在申请劳动仲裁前应咨询专业律师，以了解其权利和义务，并制定合适的仲裁策略。
4. 注意仲裁时效：员工应在知道或应当知道其权利被侵害之日起一年内申请劳动仲裁，以免丧失权利。

举例说明：假设员工A在上班途中发生交通事故，非本人主要责任，且已认定为工伤。但A在发生事故后未及时申请仲裁，且已超过一年的仲裁时效期间。此时，A可能无法通过劳动仲裁要求企业赔付工伤保险待遇。但若A能证明企业存在过错，且该过错与交通事故存在因果关系，A仍可能通过其他法律途径要求企业承担赔偿责任。

后续行动建议：若您面临类似情况，建议尽快咨询专业律师，以了解您的具体权利和义务，并制定合适的法律策略。同时，注意收集相关证据，并在规定的时间内申请劳动仲裁。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。