针对您提出的企业排水量超过纳管标准应如何处罚的问题，这是一个涉及环境保护法规和行政处罚程序的复杂议题。以下是我根据相关法律法规和执法实践，为您提供的详细解答：
一、处罚依据
首先，我们需要明确的是，企业排水量超过纳管标准，即违反了水污染物排放的相关规定。根据《中华人民共和国水污染防治法》第八十三条的规定，对于超过水污染物排放标准或者超过重点水污染物排放总量控制指标排放水污染物的行为，县级以上人民政府环境保护主管部门有权进行处罚。
二、处罚种类与幅度
责令改正或限制生产、停产整治：环保部门在发现企业超标排放后，首先会责令企业立即改正违法行为，或者根据情况限制其生产、停产整治，以防止污染进一步扩大。
罚款：除了责令改正外，环保部门还会对企业处以十万元以上一百万元以下的罚款。罚款的具体数额会根据违法行为的严重程度、超标排放的污染物种类和数量、以及对企业和社会造成的影响等因素综合确定。
情节严重时的处理：如果企业的违法行为情节严重，环保部门还可以报经有批准权的人民政府批准，责令企业停业、关闭。
三、处罚程序
立案：环保部门在检查中发现或者接到举报、控告企业超标排放后，会进行审查并决定是否立案。
调查：立案后，环保部门会指定专人负责调查，收集相关证据，包括现场检查记录、监测报告等。
审查：环保部门会对案件的违法事实、证据、调查取证程序、法律适用、处罚种类和幅度等进行全面审查，并提出处理意见。
告知：在做出行政处罚决定前，环保部门会制作《环境行政处罚事先（听证）告知书》送达当事人，告知其违法事实以及依法享有的陈述、申辩和要求听证的权利。
决定：根据审理情况，环保部门会决定是否予以行政处罚，并制作行政处罚决定书，载明违法事实和证据、处罚依据和内容、申请行政复议或提起行政诉讼的途径和期限等。
送达与执行：行政处罚决定书会依法按时送达当事人，并监督当事人在决定的期限内履行生效的行政处罚决定。如果当事人不履行，环保部门可以依法采取加处罚款等强制措施。
四、特别注意事项
排放标准的适用：在处罚过程中，需要准确适用污染物排放标准。如果企业所属行业有特定的污水排放标准，应优先适用行业标准。例如，制革及毛皮加工企业应执行《制革及毛皮加工工业水污染物排放标准》。
间接排放与直接排放的区别：对于排入污水管网进而进入污水处理厂作进一步处理后排入环境的间接排放行为，应依据《水污染防治法》第八十三条第四项进行处罚，即“未按照规定进行预处理，向污水集中处理设施排放不符合处理工艺要求的工业废水”。
综上所述，企业排水量超过纳管标准将面临严厉的行政处罚。为了确保合规经营，企业应严格遵守水污染物排放标准，加强内部管理，确保废水处理设施的正常运行和达标排放。