针对您提出的“有劳动部门盖章但没有存入档案的职工招聘登记表是否有效”的问题，我们可以从法律和实际操作两个层面来进行分析。

首先，从法律层面来看，招聘登记表的有效性并不完全取决于其是否被存入档案，而更多地在于其内容是否涵盖了劳动合同的基本要素，以及双方是否对此有明确的认知和同意。以您提供的参考信息中的案例为例，贾某填写的《阳新县人才市场应聘登记表》虽然名为应聘登记表，但因其明确了合同期限、工作内容、劳动报酬、社会保险等劳动合同的基本内容，并且得到了用人单位（医院）的盖章确认，因此被法院认定为具备了劳动合同的基本条件，能够明确双方之间的劳动合同关系。

其次，从实际操作层面来看，档案的管理和保存是用人单位的责任，但档案的缺失或未存入并不直接导致招聘登记表或劳动合同的无效。用人单位有义务妥善保管录用登记、核查材料，如果未按规定保存，可能会面临劳动保障行政部门的处罚，但这并不影响已经形成的劳动合同关系的效力。

综上所述，有劳动部门盖章但没有存入档案的职工招聘登记表，如果其内容涵盖了劳动合同的基本要素，并且得到了用人单位的确认，那么它在法律上是可以被视为有效的劳动合同的替代文件的。然而，为了保障双方的权益和避免可能的纠纷，建议用人单位还是应该按照规定将相关录用登记材料妥善保管并存档。

最后，需要强调的是，每个具体案件的情况都有所不同，如果在实际操作中遇到类似问题，建议咨询专业的法律人士或劳动仲裁机构以获取更准确的法律意见。