针对您提出的“未按规定告知患者有关部门怎么处理”的问题，这通常涉及到医疗机构或医务人员在诊疗过程中未履行其法定的告知义务，从而可能引发的法律后果及处理方式。以下是我为您详细梳理的解答：
一、未履行告知义务的法律后果
根据《中华人民共和国医师法》的相关规定，医师在诊疗活动中应当向患者说明病情、医疗措施和其他需要告知的事项。若未按规定履行告知义务，医师可能面临以下法律后果：
行政处罚：
- 依据《中华人民共和国医师法》第五十五条第一项，医师在执业活动中未按照规定履行告知义务或者取得知情同意的，由县级以上人民政府卫生健康主管部门责令改正，给予警告；情节严重的，责令暂停六个月以上一年以下执业活动直至吊销医师执业证书。
- 依据《中华人民共和国医师法》第五十六条第三项，若医师隐匿、伪造、篡改或者擅自销毁病历等医学文书及有关资料（这通常与未履行告知义务相关联，如未记录告知内容），则可能面临警告、没收违法所得，并处一万元以上三万元以下的罚款；情节严重的，同样可能面临暂停执业活动或吊销执业证书的处罚。
民事责任：
- 若因未履行告知义务导致患者损害，医疗机构或医务人员可能需承担民事赔偿责任，包括赔偿患者因未获知相关信息而遭受的损失。
刑事责任：
- 在极端情况下，若未履行告知义务的行为构成犯罪（如因未告知导致患者死亡或严重健康损害），相关责任人员可能面临刑事责任的追究。
二、实际案例与处理方式
以您提供的案例为例，某医院值班医生李某为急诊住院患者常规治疗后，口头建议患者去外院碎石，但未执行转诊审批流程，未与患者或其家属签署相关书面资料，未告知可能存在的风险，且擅自修改病历。该医生的行为违反了《中华人民共和国医师法》的相关规定，因此受到了警告、罚款贰万元整、暂停六个月执业活动的行政处罚。
三、建议与启示
严格遵守法律法规：
- 医疗机构和医务人员应严格遵守《中华人民共和国医师法》等相关法律法规，确保在诊疗过程中充分履行告知义务。
完善告知流程：
- 医疗机构应建立完善的告知流程，包括签署《病情告知书》《离院责任书》等书面资料，确保患者或其家属充分了解病情、治疗措施及可能存在的风险。
加强病历管理：
- 医务人员应按照规定及时、准确、完整地填写病历等医学文书，不得隐匿、伪造、篡改或擅自销毁病历资料。
提升法律意识：
- 医疗机构和医务人员应提升法律意识，认识到未履行告知义务可能带来的严重法律后果，从而更加重视和规范执行告知义务。
综上所述，未按规定告知患者可能面临行政处罚、民事责任甚至刑事责任。医疗机构和医务人员应严格遵守相关法律法规，完善告知流程，加强病历管理，并提升法律意识，以确保患者的知情权和选择权得到充分保护。