公司公章可以由法定代理人保管，但并非绝对，具体取决于公司章程或内部规章制度的规定。以下是对此问题的详细分析：
一、公司公章的保管原则
公司章程优先：根据《中华人民共和国公司法》及相关规定，公司公章的保管事宜通常遵循公司章程或内部管理规章制度。这意味着，如果公司章程中明确规定了公章的保管人，那么应当按照章程的规定执行。
无规定时的默认做法：如果公司章程中没有明确规定公章的保管人，那么在实际操作中，公章可能由公司的法定代表人亲自掌管，或者由公司的行政办公部门、财务部门负责管理，甚至委派特定的专员负责保管。这种做法在业界较为普遍，但并非绝对。
二、法定代表人保管公章的合法性
法定代表人的角色：法定代表人作为公司的法律代表，有权代表公司进行各种法律行为。因此，从法律角度来看，法定代表人保管公章是合法的，也是合理的。
保管责任：无论公章由谁保管，保管人都需要承担相应的保管责任。如果因保管不善或滥用公章导致公司遭受经济损失，保管人可能需要承担相应的法律责任。因此，即使公章由法定代表人保管，也需要确保其妥善保管并合法使用。
三、公司公章保管的实践建议
明确保管制度：为了确保公章的安全和合法使用，公司应当制定明确的公章保管制度。该制度应当包括公章的保管人、保管地点、使用流程、审批程序等内容。
加强内部监督：公司应当加强对公章使用的内部监督，确保公章的使用符合公司章程和内部规章制度的规定。同时，公司还可以考虑采用电子印章等先进技术手段，提高公章使用的安全性和便捷性。
及时变更登记：如果公司法定代表人发生变更，或者公章保管人发生变更，公司应当及时办理相关变更登记手续，确保公章使用的合法性和有效性。
四、法律后果
如果公司公章保管不善或滥用，可能导致公司遭受经济损失，甚至引发法律纠纷。在这种情况下，相关责任人可能需要承担民事责任、行政责任甚至刑事责任。因此，公司应当高度重视公章的保管和使用问题，确保公章的安全和合法使用。
如有任何关于公司公章保管或使用的法律问题，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业的法律意见和建议。