结论：公司法人章和公章并非必须由法人（即法定代表人）保管，具体的保管安排应根据公司章程、实际需求及风险防控原则来确定。
详细分析：
公司章程的优先性：
- 公司章程是公司治理的基本准则，其中可能明确规定了法人章和公章的保管人。若章程中有明确规定，则应严格按照章程执行，这是公司内部管理的基本原则。
法人章的保管：
- 法人保管的合理性：法人章代表了公司的整体行为，具有法律效应。在章程未明确指定的情况下，由法定代表人保管法人章是合理的，因为其行为直接代表公司，便于行使职权和确保公司行为的合法性与规范性。
- 其他保管方式：出于公司治理和风险防控的考虑，公司也可以将法人章交由其他特定人员或部门保管，如财务负责人、总经理指定人员或专门的印章管理部门。这样做可以避免权力过度集中，防止因个人不当行为给公司带来风险，并确保印章使用流程的规范、透明与可监督性。
公章的保管：
- 公章的重要性：公章是公司在工商部门登记备案的行政公章，代表公司对外、对内行使行政权力并承担责任。因此，公章的保管需极为谨慎。
- 保管主体的选择：公章一般由公司的高级管理层，如董事长或总经理来负责保管。对于规模较大或印章使用频繁的公司，也可以考虑设立专门的印章管理岗位，选拔责任心强、忠诚度高的员工担任印章保管人。
- 保管的灵活性：虽然公章的保管需谨慎，但法律并未强制规定必须由法定代表人保管。公司可以根据自身的管理需求和业务流程，灵活安排公章的保管人。
印章管理制度的建立：
- 内控制度的完善：无论法人章和公章由谁保管，公司都应建立完善的内控制度，明确印章的使用流程、审批权限、登记备案等规定。例如，可以规定印章的使用需经两个股东以上同意并进行登记，以确保使用的合法性和规范性。
- 审批和登记制度的执行：每次使用印章前，应经过相应的审批流程；使用后，应及时进行登记备案，以便追踪和查证。
- 责任追究机制的建立：公司应建立责任追究机制，对违规使用印章或造成印章丢失、被盗等后果的责任人进行严肃处理，以维护公司的法律安全和经济利益。
实际操作中的建议：
- 保管人的选任：应选任具备高度责任心和忠诚度的员工担任印章保管人，并定期对保管人进行培训和考核，确保其能够胜任印章保管工作。
- 印章的安全存放：印章应存放在安全、保密的地方，避免被他人非法获取或使用。同时，应定期对印章进行盘点和检查，确保印章的完整性和安全性。
- 印章使用的监督：公司应加强对印章使用过程的监督和管理，确保印章的使用符合公司的意志和法律法规的要求。对于违规使用印章的行为，应及时发现并予以纠正。
可能的风险与后果：
- 法律风险：若印章保管不善或违规使用，可能导致公司面临法律纠纷和诉讼风险，损害公司的声誉和利益。
- 经济风险：印章的滥用或盗用可能导致公司遭受经济损失，如合同诈骗、资金挪用等。
- 管理风险：印章保管不当还可能影响公司的内部管理秩序和运营效率，导致公司治理水平下降。
综上所述，公司法人章和公章的保管问题应根据公司章程、实际需求及风险防控原则来确定。无论由谁保管，都需建立完善的印章管理制度和内部控制机制，以确保印章的安全、合规使用。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。