您好，关于公交公司登记身份证是否合法的问题，这主要涉及到实名认证和公民信息保护的法律框架。

首先，从实名认证的角度来看，根据市场监管总局的相关规定，以及《市场主体登记管理条例》及其实施细则，实名认证是规范经营主体登记管理秩序、防范和查处冒名登记违法行为的重要手段。在公司办理登记、备案事项时，相关人员（如法定代表人、股东、董事、监事及高级管理人员）需要配合登记机关通过实名认证系统进行实名验证。这种实名认证的要求，旨在保护公民合法权益，防止假冒他人名义进行登记的违法行为。

然而，公交公司作为提供公共交通服务的主体，其登记身份证的行为是否合法，需要具体看其登记身份证的目的、方式和范围。如果公交公司是为了提供更安全、便捷的服务，比如实名制购票、乘车，或者为了防范和打击违法犯罪行为，如逃票、携带违禁品等，而要求乘客登记身份证信息，并且这种登记是在合法、合规的框架下进行的，那么这种行为是合法的。

但另一方面，公交公司也必须严格遵守《中华人民共和国居民身份证法》等相关法律法规，保护公民的个人信息不被泄露或滥用。居民身份证是公民的重要身份证明，包含了公民的姓名、性别、民族、出生日期、常住户口所在地住址、公民身份号码等敏感信息。公交公司在登记和使用这些信息时，必须确保信息的安全性和保密性，不得将信息用于非法目的或泄露给第三方。

总结来说，公交公司登记身份证的行为本身并不违法，但必须满足以下条件：一是登记目的合法，如为了提供安全、便捷的服务或防范违法犯罪行为；二是登记方式合规，遵循相关法律法规和实名认证的要求；三是保护公民个人信息不被泄露或滥用。如果公交公司能够满足这些条件，那么其登记身份证的行为就是合法的。