员工可以追讨扣发的工资，并且有权要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律角度
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位无故辞退员工属于违法解除劳动合同的行为。在此情况下，员工不仅有权要求公司支付被扣发的工资，还有权要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金。具体来说：
工资追讨：
- 员工有权要求公司按照劳动合同的约定，全额支付被扣发的工资。
- 如果公司拒绝支付，员工可以向劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁、诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
赔偿金支付：
- 根据《劳动合同法》第八十七条，用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同的，应当依照本法第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
- 经济补偿标准通常按照员工在公司的工作年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。
二、实际操作角度
收集证据：
- 员工在追讨工资和赔偿金时，应首先收集相关证据，如劳动合同、工资条、辞退通知等，以证明公司存在违法解除劳动合同和扣发工资的行为。
协商与调解：
- 在收集到足够证据后，员工可以尝试与公司进行协商，要求公司支付被扣发的工资和赔偿金。
- 如果协商无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁进行调解。
法律途径：
- 如果调解仍无法解决问题，员工可以向人民法院提起诉讼，要求公司支付被扣发的工资和赔偿金。
- 在诉讼过程中，员工应提供充分的证据来支持自己的主张，并遵循法院的审理程序。
三、注意事项
时效性：
- 员工在追讨工资和赔偿金时，应注意时效性。根据《劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
专业咨询：
- 由于劳动纠纷涉及的法律条款和程序较为复杂，员工在追讨工资和赔偿金时，如有需要可以向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议。
举例说明：
假设某员工在公司工作了两年，每月工资为5000元。公司无故辞退该员工，并扣发了其最后一个月的工资。在此情况下，员工有权要求公司支付被扣发的5000元工资，并有权要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金，即2个月工资（5000元/月 × 2月）的二倍，共计20000元。
综上所述，员工在遭遇公司无故辞退并扣发工资时，应勇敢维护自己的合法权益，通过法律途径追讨应得的工资和赔偿金。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。