车祸起诉费一般不可以直接申请在判决生效后由法院代扣。以下是对此问题的详细分析：
一、起诉费的基本性质与支付方式
起诉费，即诉讼费，是当事人向法院提起诉讼时，根据法律规定需要预先缴纳的费用。这笔费用通常用于覆盖法院在审理案件过程中产生的各项开支，如审判人员薪酬、法庭设施使用、证据收集与鉴定等。在交通事故赔偿等民事案件中，起诉费的支付一般遵循“谁起诉、谁预付”的原则，即由提起诉讼的一方当事人预先支付。
二、判决生效后的费用处理
判决内容：在交通事故赔偿案件中，法院会根据双方提供的证据和法律规定，作出相应的判决。判决内容可能包括赔偿金额、责任划分等。
费用承担：关于起诉费的承担，法院通常会在判决中明确。如果判决被告承担部分或全部起诉费，那么被告需要按照判决指定的期限和方式支付这笔费用。但这并不意味着起诉费可以直接从判决金额中代扣。
执行程序：如果被告未按照判决指定的期限支付起诉费或其他赔偿款项，原告可以申请法院强制执行。在执行过程中，法院有权采取多种措施来确保判决得到履行，如查封、扣押、拍卖被告的财产等。然而，这并不意味着起诉费可以直接由法院从判决金额中代扣，而是需要通过执行程序来单独追缴。
三、特殊情况下的处理
虽然一般情况下起诉费不能直接由法院代扣，但在某些特殊情况下，如当事人之间存在明确的协议或法院认为有必要采取特殊措施时，可能会考虑变通处理。然而，这种情况非常罕见，且需要严格的法律程序和证据支持。
四、建议与注意事项
及时缴纳起诉费：作为原告，在提起诉讼时应及时缴纳起诉费，以确保案件能够顺利进行。
关注判决内容：在收到判决后，应仔细阅读判决内容，了解起诉费和其他赔偿款项的承担方式。
申请强制执行：如果被告未按照判决指定的期限支付款项，应及时向法院申请强制执行，以维护自己的合法权益。
咨询专业律师：在处理交通事故赔偿等复杂法律问题时，建议咨询专业律师以获取更详细的法律建议和指导。
如有任何关于交通事故赔偿或起诉费支付方面的疑问，请直接向我咨询。我将根据你的具体情况提供针对性的法律建议。