在综合计算工时工作制下，员工依然享有带薪年休假的权利，其休假安排需遵循相关法律法规，并结合该工时制度的特殊性进行。以下是对综合工时制度下年假如何休的详细解答：
一、享受年假的条件
根据《职工带薪年休假条例》，只要员工连续工作满1年，无论是在同一单位还是不同单位，都具备享受带薪年休假的资格。这一规定适用于所有工时制度下的员工，包括综合计算工时工作制的员工。
二、年假天数的计算
年假天数的计算主要依据员工的工作年限：
- 累计工作已满1年不满10年的：年休假5天；
- 已满10年不满20年的：年休假10天；
- 已满20年的：年休假15天。
需要注意的是，国家法定休假日、休息日不计入年休假的假期。
三、年假的安排与使用
单位统筹安排：
- 年休假可在1个年度内集中或分段安排，一般不跨年度。
- 对于综合计算工时工作制的企业，由于其工作时间具有灵活性，单位可根据生产经营实际情况，在不影响员工权益的前提下，统筹安排年休假。例如，可以在生产淡季或员工相对空闲的时间段安排年假。
员工申请：
- 员工可根据个人情况向单位提出年休假申请。
- 单位应在保障生产经营正常进行的前提下，尽量满足员工的合理需求。例如，员工因家庭原因需要提前休假，单位在条件允许的情况下应予以批准。
协商安排：
- 鉴于综合计算工时工作制可能带来的工作时间与年假安排的冲突，劳动者应与用人单位进行充分协商。
- 双方可就年假的具体时间、方式等进行沟通，确保年假的安排既符合法律法规要求，又满足员工的实际需求。
四、特殊情况处理
加班与年假：
- 在综合计算周期内，具体日（或周）的实际工作时间可超过8小时（或40小时），但总实际工作时间不应超总法定标准工作时间。
- 超时部分视为延长工作时间，企业应按不低于员工本人小时工资标准的150%支付加班工资。
- 若员工在年休假期间被安排工作，则应按不低于员工本人日或小时工资标准的300%支付年休假工资报酬。
解除或终止劳动合同：
- 当用人单位与职工解除或终止劳动合同时，应折算并支付未休年休假工资报酬。
- 折算方法：（当年度在本单位已过日历天数÷365天）×职工本人全年应当享受的年休假天数 - 当年度已安排年休假天数。折算后不足1整天的部分不支付。
五、特别注意事项
- 每周至少休息一天：根据《劳动法》规定，用人单位应保证劳动者每周至少休息一天。在安排带薪年假时，也需考虑此因素，确保劳动者的休息时间得到充分保障。
- 沟通与协商：在实际操作中，劳动者与用人单位应进行充分沟通，合理安排年假。如有任何疑问或争议，建议及时咨询专业律师或劳动监察部门。
综上所述，综合计算工时工作制下的员工在享受带薪年休假方面，既遵循了一般性规定，也需考虑该工时制度的特殊性。通过单位统筹安排、员工申请以及双方协商等方式，可以确保年假的安排既合法又合理，从而保障员工的合法权益。