综合工时制下，带薪年休假的安排与标准工时制基本一致，但需结合综合工时制的特点进行具体操作。具体分析如下：

1. 年休假天数确定
   根据《职工带薪年休假条例》第三条，年休假天数由职工累计工作时间决定：

   • 累计工作满1年不满10年的，年休假5天；
     
   • 满10年不满20年的，年休假10天；
     
   • 满20年的，年休假15天。
     综合工时制不影响年休假天数的计算，仅需以社保缴纳记录、劳动合同等证明累计工作时间。

2. 年休假安排原则

   • 单位统筹安排：用人单位可根据生产、工作情况，结合职工意愿，统筹安排年休假，一般需提前30日通知职工。
     
   • 职工主动申请：职工也可向单位提出年休假申请，单位应予以批准（除非因生产需要无法安排）。
     
   • 跨年度安排：年休假一般不跨年度安排，但单位因生产特点确有必要跨年度安排的，可跨1个年度安排（需职工书面同意）。

3. 综合工时制下的特殊考量

   • 工时平衡：综合工时制以周、月、季、年为周期综合计算工作时间，若职工在周期内已通过加班完成工作任务，单位仍需安排年休假，不得以“已加班”为由剥夺年休假权利。
     
   • 未休年休假工资：若单位因生产需要无法安排年休假，需按职工日工资收入的300%支付未休年休假工资报酬（含正常工资，即额外支付200%）。
     
   • 离职时处理：职工离职时，未休年休假天数按当年已工作时间折算（折算后不足1整天的部分不支付），单位需按日工资收入的200%支付工资。

4. 操作建议

   • 制度明确：在劳动合同或规章制度中明确综合工时制下年休假的安排方式，避免纠纷。
     
   • 记录留存：保存职工累计工作时间证明、年休假安排通知、职工申请记录等材料，以备查验。
     
   • 协商沟通：安排年休假时充分与职工沟通，尽量平衡生产需求与职工休息权。

若您在综合工时制年休假安排中遇到具体问题（如单位拒绝安排、工资计算争议等），可直接向我咨询，我会结合您的实际情况提供详细解答。