在综合工时制下，关于年休假如何计算工时的问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：

一、年休假的基本性质

年休假是《职工带薪年休假条例》明确赋予劳动者的合法权益，它的主要目的是保障劳动者在连续工作一段时间后，能够有时间休息和放松，从而恢复体力和精力。年休假是劳动者的一种福利，其本质是为了让劳动者得到充分的休息，而非继续提供劳动。

二、综合工时制的特点与工时计算原则

综合工时制是一种特殊的工时制度，它以一定周期（如周、月、季、年）为单位来综合计算工作时间。在这种制度下，虽然具体的工作时间安排更加灵活，但平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。工时计算主要依据劳动者实际从事工作的时间，年休假期间劳动者并未实际提供劳动，因此不应将年休假时间计算在工时内。

三、年休假在综合工时制下的具体处理

1. 不计入工时：

   • 在综合工时制下，年休假不应算作工时。这是基于年休假的性质和综合工时制的特点得出的结论，既符合法律法规的规定，也体现了对劳动者休息权利的尊重和保护。

2. 工资支付：

   • 劳动者在年休假期间是享有带薪待遇的。用人单位应按照劳动者正常工作期间的工资收入支付年休假工资报酬，确保劳动者在享受年休假的同时，不会因未实际工作而遭受经济损失。

3. 工时统计与管理：

   • 用人单位在统计和管理综合工时制下的工时情况时，应明确区分正常工作时间、加班时间和年休假时间等不同的时间类别。这有助于确保工时计算的准确性和合规性，同时也有助于用人单位有效管理员工的工作时间。

四、实际操作中的建议

1. 合理安排工作与休息：

   • 用人单位应根据生产需求和劳动者的实际情况，合理安排员工的工作和休息时间。确保劳动者在综合计算周期内既能完成工作任务，又能享受到充分的休息。

2. 建立健全的考勤制度：

   • 用人单位应建立健全的考勤制度和工时记录制度，准确记录劳动者的出勤情况和工时使用情况。这有助于在发生劳动争议时提供有力的证据支持，同时也有助于用人单位更好地管理员工的工作时间。

3. 遵守相关法律法规：

   • 用人单位在实施综合工时制时，应严格遵守相关法律法规的规定，确保劳动者的合法权益得到有效保障。如需变更工时制度或调整年休假安排等，应提前与劳动者协商并取得其同意。

综上所述，综合工时制下的年休假不应算作工时。用人单位应合理安排员工的工作和休息时间，确保劳动者在享受年休假的同时，其合法权益得到有效保障。