核心前提：用户询问的是公司在收到工伤申请决定书后是否会配合。
结论前置：
公司配合的可能性：在大多数情况下，公司收到工伤申请决定书后会配合进行后续的工伤认定和赔偿流程，因为这是法律规定的义务，且配合处理有助于维护公司形象和员工关系。
公司不配合的可能情况及应对：然而，也存在公司不配合的情况，这可能是由于公司对工伤认定有异议、担心赔偿金额过高或其他原因。在这种情况下，员工可以采取以下措施：
详细分析：
公司配合的义务：根据《工伤保险条例》等相关法律法规，公司在收到工伤申请决定书后，有义务配合进行后续的工伤认定和赔偿流程。这包括提供必要的证明材料、协助调查等。公司配合处理不仅有助于员工及时获得工伤赔偿，也有助于维护公司的良好形象和员工关系。
公司不配合的原因及应对：尽管公司有配合的义务，但在实际操作中，也可能存在公司不配合的情况。这可能是由于公司对工伤认定有异议，认为员工的伤害不属于工伤范围；或者担心赔偿金额过高，对公司财务造成压力；还有其他可能的原因。在这种情况下，员工应首先尝试与公司进行沟通，了解公司不配合的具体原因，并寻求解决方案。如果沟通无果，员工可以向当地人力资源和社会保障部门申请行政复议，或者向人民法院提起行政诉讼。同时，员工也可以寻求专业律师的法律援助，以确保自己的合法权益得到充分保障。
总结：公司在收到工伤申请决定书后，通常会配合进行后续的工伤认定和赔偿流程。然而，也存在公司不配合的情况。在这种情况下，员工应积极采取措施，包括与公司沟通、申请行政复议或提起行政诉讼、寻求法律援助等，以确保自己的合法权益得到保障。如果您在工伤认定或赔偿过程中遇到任何问题，可以直接向我咨询。