针对您提出的“三年后才发现死亡因为医疗事故怎么办”这一问题，我理解您现在可能正面临一个复杂且棘手的法律情境。以下是我为您提供的清晰、详细且有深度的解答：

首先，我们需要明确的是，医疗事故的诉讼时效一般为三年，这个时效是从患者或其近亲属知道或应当知道身体健康受到损害之日起开始计算的。在您的情况下，如果是在死亡三年后才发现是因为医疗事故，那么我们需要根据具体情况来判断是否已经超过了诉讼时效。

1. 判断诉讼时效是否已过：

   • 如果在三年内，患者的近亲属已经知道或者应当知道医疗事故的存在，那么他们可以在三年内提起诉讼。
   • 如果超过三年才发现，那么可能会因为超过诉讼时效而面临败诉的风险。但这里需要注意的是，诉讼时效并不是绝对的，存在中止、中断的情形。

2. 诉讼时效中止、中断的情形：

   • 诉讼时效中止：通常发生在不可抗力或其他导致权利人不能行使请求权的客观情况发生时，比如患者或其近亲属因疾病、意外等原因无法及时主张权利。
   • 诉讼时效中断：如果患者在三年内曾向医疗机构主张过权利，或者医疗机构曾承诺解决纠纷等，这些都可能导致诉讼时效中断，并重新计算。

3. 如何处理：

   • 收集证据：首先，您需要收集与医疗事故相关的所有证据，包括病历、诊断证明、检查报告、医疗费用票据等。这些证据将有助于您在后续的协商、调解或诉讼中证明医疗事故的存在以及损害后果。
   • 与医疗机构协商：您可以尝试与医疗机构进行协商，要求其对事故进行调查和处理。在协商过程中，保持冷静和理性，明确表达您的诉求和理由。
   • 申请卫生行政部门调解：如果协商不成，您可以向当地的卫生行政部门提出调解申请。卫生行政部门将作为中立的第三方，帮助您和医疗机构进行协商和调解。
   • 提起诉讼：如果协商和调解都无法解决问题，且您认为诉讼时效尚未过期或存在中止、中断的情形，那么您可以在诉讼时效内向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，您需要提交起诉状及证据，并通过司法鉴定确定医疗机构是否存在过错、过错与损害后果之间的因果关系及责任程度。

4. 注意事项：

   • 在处理医疗事故时，准确把握诉讼时效极为关键。因此，建议您尽快咨询专业律师，了解您的具体权益和可能的法律途径。
   • 同时，保持与医疗机构的良好沟通，避免情绪化的冲突和对抗，有助于问题的顺利解决。

总之，面对三年后才发现的医疗事故，您需要冷静分析、积极应对。通过收集证据、与医疗机构协商、申请卫生行政部门调解或提起诉讼等方式，努力维护自己的合法权益。希望我的解答能够对您有所帮助。