1. 关于合同管辖指定区和被告所在区不同是否有效的问题：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。因此，如果合同中明确指定了管辖法院，并且该指定不违反级别管辖和专属管辖的规定，那么该指定是有效的，即使与被告所在区不同。

2. 不同情况下的分析：

   • 情况一：合同中明确指定了管辖法院：
     • 在这种情况下，只要指定的管辖法院符合法律规定（即不违反级别管辖和专属管辖），那么该指定就是有效的。无论被告所在区如何，都应当按照合同中的约定来确定管辖法院。
   • 情况二：合同中未明确指定管辖法院：
     • 如果合同中未明确指定管辖法院，那么应当根据法律规定来确定管辖法院。一般来说，被告住所地或者合同履行地的人民法院有管辖权。在这种情况下，如果被告所在区与合同履行地不一致，那么需要根据具体情况来判断哪个法院有管辖权。

3. 法律建议：

   • 在签订合同时，建议明确约定管辖法院，以避免未来可能出现的管辖争议。
   • 如果合同中已经约定了管辖法院，但双方对管辖问题产生争议，建议及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并采取相应的法律措施。
   • 在处理合同纠纷时，应当注意保留相关证据，以便在需要时能够证明自己的主张。

4. 可能的法律后果：

   • 如果合同中明确指定了管辖法院，并且该指定有效，那么双方应当按照合同中的约定来确定管辖法院。如果一方违反约定，向其他法院提起诉讼，可能会被对方提出管辖权异议，导致诉讼程序受阻。
   • 如果合同中未明确指定管辖法院，或者指定的管辖法院违反法律规定，那么可能会导致管辖争议，增加诉讼成本和时间。

综上所述，合同管辖指定区和被告所在区不同是否有效，取决于合同中的约定以及该约定是否符合法律规定。在签订合同时，建议明确约定管辖法院，以避免未来可能出现的管辖争议。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询。