关于公司要扣工资赔偿金是否合法的问题，这需要根据具体情况来判断。以下是我从多个角度为你进行的分析：

1. 合法扣工资的情形：

   • 代扣代缴法定款项：公司可以依法代扣代缴员工的个人所得税、社会保险费用、住房公积金等法定应由员工个人负担的费用。
   • 依据合法有效的规章制度：如果公司通过民主程序制定了合法有效的规章制度，并且这些制度已向员工公示，那么在员工违反规章制度时，公司有权按照制度规定扣除相应工资。但扣除的比例和方式需符合法律规定，不能随意克扣。
   • 员工给公司造成经济损失：若员工因故意或重大过失给公司造成经济损失，公司可以要求员工赔偿，并可从其工资中扣除赔偿费用。但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。
   • 绩效工资调整：绩效工资作为浮动工资部分，公司可以根据员工的绩效考核结果来调整其绩效工资。这种调整应基于公平、公正的原则，并且与员工的绩效表现直接相关。

2. 非法扣工资的情形：

   • 无明确规章制度依据：如果公司没有制定合法有效的规章制度，或者规章制度未明确规定扣工资的情形，那么公司随意扣除员工工资是不合法的。
   • 超出法定扣除范围：公司不能因员工对工作安排提出合理异议、个人生活习惯等非法定或合同约定的理由而擅自扣减工资。这种扣除行为侵犯了员工的合法权益。
   • 未经员工同意的扣除：除非法律另有规定或劳动合同有明确约定，否则公司未经员工本人同意，不得擅自扣除其工资用于非法定或合同约定的事项。
   • 扣除后工资低于最低工资标准：即使存在可扣款的情形，如果扣除后的工资低于当地最低工资标准，公司也应按照最低工资标准支付员工工资。

3. 员工维权途径：

   • 与公司协商：首先尝试与公司进行沟通协商，了解扣工资的具体原因和依据，并表达自己的诉求。
   • 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，劳动监察部门会对公司的扣工资行为进行调查，并根据调查结果作出相应处理。
   • 申请劳动仲裁：如果员工对公司的扣工资行为有异议，且无法通过协商或投诉解决，可以选择向劳动仲裁机构申请劳动仲裁。劳动仲裁机构会依法进行裁决，保障员工的合法权益。

综上所述，公司扣工资赔偿金是否合法，关键在于是否有明确的规章制度依据、扣工资是否合理以及是否遵循了法定程序。如果你认为公司的扣工资行为不合法，可以通过上述途径来维护自己的权益。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。