针对您提出的“用人单位中途更换营业执照，劳动者申请仲裁以谁为被告”的问题，以下是我的详细解答：

1. 一般原则：

   • 以变更后的用人单位为被告：当用人单位中途更换营业执照，即发生了用人单位名称、法定代表人等主要登记事项的变更时，根据《中华人民共和国民法典》及相关劳动法律法规的规定，变更后的用人单位应当承担原用人单位的权利和义务。因此，劳动者在申请劳动仲裁时，应以变更后的用人单位为被告。

2. 特殊情况处理：

   • 若用人单位未办理变更登记，但实际已变更：在某些情况下，用人单位可能已经实际发生了变更，但尚未办理工商变更登记。此时，劳动者需要收集相关证据，如内部文件、通知、工资支付记录等，以证明用人单位的实际变更情况。在仲裁或诉讼过程中，这些证据将有助于确定真正的责任主体。
   • 若涉及用人单位合并、分立等情况：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十四条的规定，用人单位发生合并或者分立等情况，原劳动合同继续有效，劳动合同由承继其权利和义务的用人单位继续履行。因此，在用人单位合并或分立的情况下，劳动者应以承继其权利和义务的用人单位为被告。

3. 法律建议：

   • 及时收集证据：在发现用人单位更换营业执照或发生其他变更时，劳动者应及时收集相关证据，以备不时之需。
   • 咨询专业律师：虽然我在此提供了基本的法律建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，我建议您在面临此类问题时，直接向我咨询，以便我能根据您的具体情况提供更准确的法律建议。
   • 注意仲裁时效：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。因此，劳动者在发现用人单位存在违法行为时，应及时申请仲裁，以免错过时效期间。

综上所述，当用人单位中途更换营业执照时，劳动者在申请劳动仲裁时一般应以变更后的用人单位为被告。但在特殊情况下，如用人单位未办理变更登记但实际已变更，或涉及用人单位合并、分立等情况时，劳动者需要根据具体情况确定被告。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。