核心结论：在建设工程施工合同中，若专用条款没有约定逾期付款违约金，通常可以适用通用条款的相关规定，但需结合合同整体内容、交易习惯及法律规定进行综合判断。

1. 合同条款的适用原则：

   • 在建设工程施工合同中，专用条款和通用条款共同构成合同的完整内容。专用条款通常针对特定项目的特殊情况进行约定，而通用条款则提供了一般性的规定。
   • 当专用条款未对某一事项作出特别约定时，应首先考虑是否可以适用通用条款的相关规定。这是因为通用条款作为合同的一部分，同样具有法律效力，且旨在为合同双方提供基本的权利义务框架。

2. 逾期付款违约金的适用：

   • 若专用条款中未明确约定逾期付款违约金，而通用条款中有相关条款，则通常可以适用通用条款的规定来计算逾期付款违约金。但需注意，通用条款的适用并非绝对，还需考虑合同双方的真实意图、交易习惯以及法律规定。
   • 例如，如果合同双方在签订合同时已经明确知晓并接受了通用条款的内容，且通用条款中的逾期付款违约金规定与合同目的、交易习惯等相符，那么适用通用条款来计算逾期付款违约金是合理的。

3. 法律规定的补充作用：

   • 在合同条款未作明确约定或约定不明确的情况下，还可以依据相关法律法规的规定来确定逾期付款违约金的计算方式。例如，《民法典》中关于违约责任的规定，可以作为确定逾期付款违约金的参考依据。

4. 实际操作中的注意事项：

   • 在适用通用条款或法律规定来确定逾期付款违约金时，应确保计算方式的合理性和公平性。避免因计算方式不当而导致合同双方权益失衡。
   • 同时，合同双方在签订合同时应尽可能明确约定各项条款，包括逾期付款违约金的计算方式等，以减少后续争议的发生。

综上所述，在建设工程施工合同中，若专用条款没有约定逾期付款违约金，通常可以适用通用条款的相关规定，但需结合合同整体内容、交易习惯及法律规定进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。