当专用条款与通用条款约定的违约情形不一致时，通常优先适用专用条款的约定，而不能同时适用两者。以下从几个角度进行详细分析：

1. 合同条款的优先级

在建设工程施工合同中，合同通常由合同协议书、通用条款和专用条款三部分组成。通用条款是根据相关法律法规制定的，具有普遍性和通用性，适用于各类建设工程施工。而专用条款则是发包人与承包人根据具体工程实际，经协商达成一致意见的条款，是对通用条款的具体化、补充或修改。

法律实践中，当专用条款与通用条款就同一事项作出不一致约定时，法院通常会优先适用专用条款。这是因为专用条款是双方根据具体工程情况协商确定的，更能体现双方的真实意思表示。例如，在广东省佛山市中级人民法院的(2014)佛中法民一终字第372号案件中，法院明确指出，当通用条款与专用条款内容不一致时，应适用专用条款中双方约定的内容。

2. 合同解释的原则

在合同解释上，有一个基本原则叫做“特别条款优于一般条款”。这意味着，当合同中存在特别条款（如专用条款）和一般条款（如通用条款）时，特别条款应当优先适用。这是因为特别条款是针对特定情况或特定事项作出的约定，更能反映双方在该特定情况下的真实意愿。

3. 可能的例外情况

虽然专用条款通常优先适用，但也存在一些例外情况。例如，如果专用条款的约定违反了法律法规的强制性规定，或者存在显失公平、欺诈、胁迫等情形，那么该约定可能被认定为无效或可撤销。在这种情况下，法院可能会根据相关法律法规或公平原则，对违约情形进行重新认定。

4. 实际操作建议

• 审查合同条款：在签订合同时，双方应仔细审查通用条款和专用条款的内容，确保两者之间没有矛盾或不一致之处。如果发现存在不一致之处，应及时进行协商和修改。
• 明确约定：在专用条款中，双方应尽可能明确、具体地约定违约情形和违约责任，以避免在履行过程中产生争议。
• 保留证据：在合同履行过程中，双方应妥善保留与违约情形相关的证据，以便在发生争议时能够证明自己的主张。

5. 法律后果

如果双方在合同中未明确约定专用条款与通用条款的优先级，或者在发生争议后无法就违约情形达成一致意见，那么可能会引发诉讼或仲裁等法律程序。在这种情况下，法院或仲裁机构将根据相关法律法规和合同条款进行裁决，这可能会给双方带来不必要的法律风险和成本。

总结来看，当专用条款与通用条款约定的违约情形不一致时，应优先适用专用条款的约定。但双方也应注意合同条款的审查和明确约定，以避免在履行过程中产生争议。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。