当员工的工作能力不能胜任其岗位时，公司若需解除劳动关系，必须严格遵循一系列法律程序和规定，以确保操作的合法性与合规性。以下是详细的解答步骤：
一、明确岗位职责与初次考核
明确职责与标准：
- 公司应确保每个岗位都有清晰、具体、合理且可量化的工作职责和考核标准。
- 这些标准应在员工入职时通过劳动合同、员工手册或岗位说明书等书面文件明确告知，以便员工了解并遵循。
初次绩效考核：
- 公司应按照既定的考核标准对员工进行全面、客观、公正的考核。
- 考核结果应保留书面记录，作为后续处理的依据。
- 若员工未能达到考核标准，公司应下达《不能胜任工作整改通知书》，给予一定的改进期限，并明确改进目标和要求。
二、培训与调岗
职业培训：
- 对于初次考核不合格的员工，公司应提供有针对性的培训，旨在提高其工作能力，使其能够胜任工作岗位。
- 培训内容应与员工的工作岗位和不胜任的具体方面紧密相关，并保留完整的培训记录，包括培训时间、内容、方式等。
合理调岗：
- 若培训无效或不可行，公司应考虑将员工调整至其他适合的岗位。
- 调岗应具有合理性，不得为恶意逼迫员工离职而进行。调岗前，公司应与员工进行充分沟通，并签订书面的调岗协议，明确新岗位的职责、待遇等情况。
三、二次考核与通知
再次考核：
- 员工经过培训或调岗后，公司应再次按照既定的考核标准进行考核。
- 两次考核应具有连续性，且结果均显示员工不胜任工作，公司方可考虑解除劳动合同。
提前书面通知：
- 根据《劳动合同法》的规定，公司决定解除劳动合同的，应提前三十日以书面形式通知员工本人，或选择额外支付员工一个月工资作为“代通知金”。
- 书面通知中应明确解除劳动合同的原因、时间以及后续安排等信息，确保员工了解并接受。
四、经济补偿与离职手续
支付经济补偿：
- 公司以员工不能胜任工作为由解除劳动合同的，应向员工支付经济补偿。
- 经济补偿金按员工在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。
办理离职手续：
- 公司应协助员工办理离职交接手续，包括工作交接、物品归还等。
- 同时，公司还应为员工办理社保、档案转出手续，并出具离职证明，确保员工能够顺利过渡到下一份工作。
五、注意事项与举证责任
全程留证：
- 在整个过程中，公司应承担举证责任，确保所有操作都有据可查。
- 包括但不限于考核记录、培训记录、调岗通知书、解除劳动合同通知书等证据材料，都应妥善保存并归档。
合法合规：
- 公司在处理员工不能胜任工作的情况时，必须严格遵守相关法律法规的规定。
- 确保所有操作都合法、合规进行，避免因程序不当或证据不足而引发法律风险。
综上所述，当员工的工作能力不能胜任其岗位时，公司应通过明确岗位职责、初次考核、培训与调岗、二次考核、提前通知、经济补偿以及办理离职手续等步骤来合法解除劳动关系。同时，公司还需注意保留好相关证据材料，确保整个过程的合法合规性，以维护公司的合法权益并避免潜在的法律风险。