针对“单位疗休养工作人员擅自离团怎么处理”这一问题，核心前提是单位组织的疗休养活动中，有工作人员未经允许擅自离团。以下是我的分析和建议：

1. 立即沟通了解情况：

   • 首先，单位应尽快与擅自离团的工作人员取得联系，了解其离团的原因和当前状况。这一步骤至关重要，因为它有助于单位判断离团行为的性质（如是否因紧急情况、个人原因等），并为后续处理提供依据。

2. 根据单位规章制度处理：

   • 单位应依据内部制定的疗休养活动规章制度，对擅自离团的工作人员进行相应处理。规章制度可能包括但不限于警告、罚款、取消后续疗休养资格等措施。处理时应确保公平、公正，并符合法律法规的要求。

3. 考虑安全与责任问题：

   • 擅自离团可能涉及工作人员的人身安全风险，以及单位因此可能承担的责任。单位应评估离团行为是否给单位带来了潜在的法律风险或经济损失，并据此采取相应措施，如要求工作人员承担部分或全部责任、购买保险以覆盖潜在风险等。

4. 加强后续管理与教育：

   • 为防止类似事件再次发生，单位应加强对疗休养活动的管理，包括明确活动纪律、加强人员监督、完善应急预案等。同时，对参与疗休养的工作人员进行安全教育和纪律教育，提高其安全意识和纪律性。

5. 法律途径（如必要）：

   • 如果擅自离团行为给单位造成了重大损失或违反了法律法规，单位可以考虑通过法律途径追究工作人员的责任。这包括但不限于提起民事诉讼要求赔偿损失、向相关部门举报等。但在采取法律行动前，单位应充分评估证据的充分性和法律程序的可行性。

综上所述，单位在处理疗休养工作人员擅自离团的问题时，应综合考虑多方面因素，采取合理、合法的措施。如有任何法律疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。