当行政处罚中出现变更违法主体的情况时，处理方式主要可以从行政机关自行纠正、行政相对人救济途径以及司法监督与纠错三个层面来考虑。以下是对这三个层面的详细解答：

一、行政机关自行纠正

1. 主动撤销或变更：

   • 适用情形：如果行政机关在作出行政处罚决定后，发现原处罚存在事实认定错误、法律适用不当或程序违法等情形，特别是涉及违法主体变更的情况，行政机关应依法主动撤销或者变更原行政处罚决定。例如，若原处罚针对的是A公司，但后续发现实际违法行为人是B公司，行政机关应主动撤销对A公司的处罚，并对B公司进行相应处罚。
   • 法律依据：《行政处罚法》第七十五条规定，行政机关应当建立健全对行政处罚的监督制度，并接受社会监督。公民、法人或其他组织对行政处罚行为有权申诉或检举，行政机关应认真审查并主动改正错误。

2. 补正程序瑕疵（虽不直接针对违法主体变更，但为程序完整性提供参考）：

   • 对于一些程序上的轻微瑕疵，如文书送达时间略有延迟但不影响当事人实体权利等，行政机关可通过补正方式消除违法状态。不过，在违法主体变更的情况下，更需关注的是事实认定和法律适用的准确性。

二、行政相对人救济途径

1. 申请行政复议：

   • 适用情形：若行政相对人（即被处罚方）认为行政处罚侵犯其合法权益，特别是涉及违法主体变更的情况，可在知道或应当知道该行政处罚之日起60日内提出行政复议申请（法律规定的申请期限超过60日的除外）。
   • 处理结果：复议机关经过审理，若认为行政处罚违法，可作出撤销、变更或确认该行政处罚违法的复议决定。
   • 法律依据：《行政复议法》第十一条规定，对行政机关作出的行政处罚决定不服的，公民、法人或其他组织可申请行政复议。

2. 提起行政诉讼：

   • 适用情形：若行政相对人对行政复议结果不满意，或在法定期限内未申请行政复议，可直接向人民法院提起行政诉讼。一般情况下，应在知道或应当知道作出行政行为之日起六个月内提起诉讼。
   • 处理结果：人民法院经审理，若认定行政处罚违法，将根据不同情况作出撤销判决、确认违法判决等。对于造成损害的，还可能判决行政机关承担赔偿责任。
   • 法律依据：《行政诉讼法》第十二条规定，人民法院受理公民、法人或其他组织对行政处罚不服提起的诉讼。

三、司法监督与纠错

1. 检察机关监督：

   • 适用情形：检察机关在履行职责中发现行政处罚存在违法情形，如行政机关工作人员滥用职权、玩忽职守导致行政处罚错误（包括违法主体变更错误）等，可向行政机关提出检察建议，督促其依法纠正。
   • 处理方式：行政机关应在收到检察建议书之日起2个月内依法履行职责，并书面回复检察院。出现国家利益或社会公共利益损害继续扩大等紧急情形的，行政机关应在15日内书面回复。行政机关不依法履行职责的，检察院可依法向人民法院提起诉讼。
   • 法律依据：《人民检察院检察建议工作规定》等相关规定明确了检察机关对行政违法行为进行监督并提出检察建议的职责和程序。

2. 审判监督程序：

   • 适用情形：已经发生法律效力的行政处罚相关的行政判决、裁定，若存在认定事实的主要证据不足、适用法律、法规确有错误等情形（包括违法主体变更错误），当事人可申请再审，人民检察院也可提出抗诉，启动审判监督程序。
   • 处理结果：再审法院经过重新审理，若认为原行政处罚违法，将依法改判，纠正原错误的判决、裁定。
   • 法律依据：《行政诉讼法》第九十条规定，当事人对已经发生法律效力的判决、裁定，认为确有错误的，可向上一级人民法院申请再审。第九十一条规定了当事人申请再审的具体情形。

综上所述，当行政处罚中出现变更违法主体的情况时，行政机关应主动纠正错误，行政相对人可通过行政复议或行政诉讼途径寻求救济，同时检察机关和司法机关也可发挥监督与纠错作用，确保行政处罚的合法性和公正性。